Разработан метод фишинга на основе метода атомно-силовой микроскопии (АСМ-фишинг) для детекции белков в растворе аналита с использованием чипа с иммобилизованным аптамером. В основе метода лежит использование эффекта биоспецифического вылавливания целевого белка из большого объёма раствора на небольшую поверхность АСМ-чипа с иммобилизованным аптамером к этому белку, используемого в качестве молекулярного зонда. Такой подход с использованием аптамеров позволяет повысить контрастность АСМ-изображения по сравнению с тем, когда в качестве молекулярных зондов используются антитела. Масс-спектрометрический (МС) анализ позволил достоверно идентифицировать целевой белок на поверхности чипа после биоспецифического фишинга, и, таким образом, доказать образование комплекса. Применение АСМ-чипа с иммобилизованным аптамером также позволяет избежать наложения пиков белка и антитела в масс-спектре.
Бухарина Н.С., Иванов Ю.Д., Плешакова Т.О., Французов П.А., Андреева Е.Ю., Кайшева А.Л., Изотов А.А., Павлова Т.И., Зиборов В.С., Радько С.П., Арчаков А.И. (2015) Асм-фишинг белка gp120 на иммобилизованные аптамеры и его масс-спектрометрическая идентификация. Биомедицинская химия, 61(3), 363-372.
Бухарина Н.С. и др. Асм-фишинг белка gp120 на иммобилизованные аптамеры и его масс-спектрометрическая идентификация // Биомедицинская химия. - 2015. - Т. 61. -N 3. - С. 363-372.
Бухарина Н.С. и др., "Асм-фишинг белка gp120 на иммобилизованные аптамеры и его масс-спектрометрическая идентификация." Биомедицинская химия 61.3 (2015): 363-372.
Бухарина, Н. С., Иванов, Ю. Д., Плешакова, Т. О., Французов, П. А., Андреева, Е. Ю., Кайшева, А. Л., Изотов, А. А., Павлова, Т. И., Зиборов, В. С., Радько, С. П., Арчаков, А. И. (2015). Асм-фишинг белка gp120 на иммобилизованные аптамеры и его масс-спектрометрическая идентификация. Биомедицинская химия, 61(3), 363-372.
Переводная версия в журнале «Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:10.1134/S1990750814020036
Kim D.K., Kerman K., Hiep H.M., Saito M., Yamamura Sh., Takamura Y., Kwon Y.S., Tamiya E. (2008) Anal. Biochem., 379, 1-7. CrossRef Scholar google search
Barbas C.F., Björling E., Chiodi F., Dunlop N., Cababa D., Jones T.M., Zebedee S.L., Persson M.A., Nara P.L., Norrby E. (1992) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89, 9339-9343. CrossRef Scholar google search
Yamada K., Yoshii S., Kumagai S., Fujiwara I., Nishio K., Okuda M., Matsukawa N., Yamashita I. (2006) Jpn. J. Appl. Phys., 45, 4259-4264. CrossRef Scholar google search
Stroh C., Wang H., Bash R., Ashcroft B., Nelson J., Gruber H., Lohr D., Lindsay S.M., Hinterdorfer P. (2004) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 101, 12503–12507. CrossRef Scholar google search
