1. Московский физико-технический институт (государственный университет), г. Долгопрудный, Россия 2. Московский физико-технический институт (государственный университет), г. Долгопрудный, Россия; ФНКЦ физико-химической медицины ФМБА России, отдел молекулярной биологии и генетики, Москва, Россия 3. ФНКЦ физико-химической медицины ФМБА России, отдел молекулярной биологии и генетики, Москва, Россия 4. Санкт-Петербургский научно-исследовательский психоневрологический институт имени В.М. Бехтерева, Санкт-Петербург, Россия
Проведено первое метагеномное исследование микробиоты кишечника у пациентов с синдромом алкогольной зависимости (САЗ) в полногеномном (англ. “shotgun”) формате. Таксономический анализ выявил изменения в относительной представленности преобладающих бактерий, ассоциированные с воспалением (в том числе повышение уровня видов Ruminococcus gnavus и R. torques, а также понижение уровня родов Faecalibacterium и Akkermansia). В микробиоте пациентов с САЗ обнаружено присутствие оппортунистических патогенов, редко детектируемых в метагеномах здоровых индивидов из разных стран мира. Согласно изменениям относительной представленности групп генов KEGG Orthology, сравнительный анализ метаболического потенциала выявил повышение уровня путей, ассоциированных с ответом на окислительный стресс. У пациентов с САЗ обнаружено повышение двух специфичных групп генов, кодирующих ферменты, участвующие в метаболизме алкоголя, а также факторы вирулентности. Предположительно, микробиота кишечника больных алкоголизмом, демонстрирующая изменения как таксономического, так и функционального состава, играет роль в модуляции воздействия алкоголя на организм хозяина.
Дубинкина В.Б. и др. Метагеномный анализ таксономических и функциональных особенностей микробиоты кишечника у пациентов с синдромом алкогольной зависимости // Биомедицинская химия. - 2015. - Т. 61. -N 6. - С. 742-749.
Дубинкина В.Б. и др., "Метагеномный анализ таксономических и функциональных особенностей микробиоты кишечника у пациентов с синдромом алкогольной зависимости." Биомедицинская химия 61.6 (2015): 742-749.
Дубинкина, В. Б., Тяхт, А. В., Ильина, Е. Н., Ищенко, Д. С., Коварский, Б. А., Ярыгин, К. С., Павленко, А. В., Попенко, А. С., Алексеев, Д. Г., Тараскина, А. Е., Насырова, , Р. Ф., Крупицкий, Е. М., Скородумова, Л. О., Ларин, А. К., Кострюкова, Е. С., Говорун, В. М. (2015). Метагеномный анализ таксономических и функциональных особенностей микробиоты кишечника у пациентов с синдромом алкогольной зависимости. Биомедицинская химия, 61(6), 742-749.
Переводная версия в журнале «Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:10.1134/S1990750816020037
Список литературы
Gilpin N.W., Koob G.F. (2008) Alc. Res. Health: J. Nat. Inst. Alc. Abuse and Alcoholism, 31(3), 185. Scholar google search
Leclercq S., Matamoros S., Cani P.D., Neyrinck A.M., Jamar F., Stärkel P., Windey K., Tremarolig V., Bäckhed F., Verbeke K., de Timarya P., Delzenne N.M. (2014) Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 111(42), E4485-E4493. CrossRef Scholar google search
Mutlu E.A., Gillevet P.M., Rangwala H., Sikaroodi M., Naqvi A., Engen P.A., Kwasny M., Lau C.K., Keshavarzian A. (2012) Am. J. Physiol. Gastrointest. Liver Physiol., 302(9), G966-G978. CrossRef Scholar google search
Queipo-Ortuño M.I., Boto-Ordóñez M., Murri M., Gomez-Zumaquero J.M., Clemente-Postigo M., Estruch R. et al. (2012) Am. J. Clin. Nutr., 95(6), 1323-1334. Scholar google search
Bull-Otterson L., Feng W., Kirpich I., Wang Y., Qin X., Liu Y., Gobejishvili L., Joshi-Barve S., Ayvaz T., Petrosino J., Kong M., Barker D., McClain C., Barve S. (2013) PLoS ONE, 8(1), e53028. CrossRef Scholar google search
Bajaj J.S., Heuman D.M., Hylemon P.B., Sanyal A.J., White M.B., Monteith P.,Noble N.A., Unser A.B., Daita K., Fisher M.R. et al. (2014) J. Hepatol., 60(5), 940-947. CrossRef Scholar google search
Zaridze D., Lewington S., Boroda A., Scélo G., Karpov R., Lazarev A., Konobeevskaya I., Igitov V. et al. (2014) Lancet, 383(9927), 1465-1473. CrossRef Scholar google search
