Метагеномный анализ таксономических и функциональных особенностей микробиоты кишечника у пациентов с синдромом алкогольной зависимости

   
Дубинкина В.Б.1 , Тяхт А.В.2, Ильина Е.Н.3, Ищенко Д.С.2, Коварский Б.А.3, Ярыгин К.С.1, Павленко А.В.2, Попенко А.С.3, Алексеев Д.Г.2, Тараскина А.Е.4, Насырова  Р.Ф.4, Крупицкий Е.М.4, Скородумова Л.О.3, Ларин А.К.3, Кострюкова Е.С.2, Говорун В.М.2

1. Московский физико-технический институт (государственный университет), г. Долгопрудный, Россия
2. Московский физико-технический институт (государственный университет), г. Долгопрудный, Россия; ФНКЦ физико-химической медицины ФМБА России, отдел молекулярной биологии и генетики, Москва, Россия
3. ФНКЦ физико-химической медицины ФМБА России, отдел молекулярной биологии и генетики, Москва, Россия
4. Санкт-Петербургский научно-исследовательский психоневрологический институт имени В.М. Бехтерева, Санкт-Петербург, Россия
Раздел: Клиническое исследование
DOI: 10.18097/PBMC20156106742      Идентификатор PubMed: 26716747
Год: 2015  том: 61  выпуск: 6  страницы: 742-749
Проведено первое метагеномное исследование микробиоты кишечника у пациентов с синдромом алкогольной зависимости (САЗ) в полногеномном (англ. “shotgun”) формате. Таксономический анализ выявил изменения в относительной представленности преобладающих бактерий, ассоциированные с воспалением (в том числе повышение уровня видов Ruminococcus gnavus и R. torques, а также понижение уровня родов Faecalibacterium и Akkermansia). В микробиоте пациентов с САЗ обнаружено присутствие оппортунистических патогенов, редко детектируемых в метагеномах здоровых индивидов из разных стран мира. Согласно изменениям относительной представленности групп генов KEGG Orthology, сравнительный анализ метаболического потенциала выявил повышение уровня путей, ассоциированных с ответом на окислительный стресс. У пациентов с САЗ обнаружено повышение двух специфичных групп генов, кодирующих ферменты, участвующие в метаболизме алкоголя, а также факторы вирулентности. Предположительно, микробиота кишечника больных алкоголизмом, демонстрирующая изменения как таксономического, так и функционального состава, играет роль в модуляции воздействия алкоголя на организм хозяина.
Загрузить PDF:
Ключевые слова: метагеном, микробиота кишечника, синдром алкогольной зависимости, метаболический потенциал, микробный метаболизм алкоголя, факторы вирулентности
Дополнительные материалы:
Цитирование:

Дубинкина, В. Б., Тяхт, А. В., Ильина, Е. Н., Ищенко, Д. С., Коварский, Б. А., Ярыгин, К. С., Павленко, А. В., Попенко, А. С., Алексеев, Д. Г., Тараскина, А. Е., Насырова, , Р. Ф., Крупицкий, Е. М., Скородумова, Л. О., Ларин, А. К., Кострюкова, Е. С., Говорун, В. М. (2015). Метагеномный анализ таксономических и функциональных особенностей микробиоты кишечника у пациентов с синдромом алкогольной зависимости. Биомедицинская химия, 61(6), 742-749.
Переводная версия в журнале
«Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:
10.1134/S1990750816020037
Список литературы  
 2019 (том 65)
 2018 (том 64)
 2017 (том 63)
 2016 (том 62)
 2015 (том 61)
 2014 (том 60)
 2013 (том 59)
 2012 (том 58)
 2011 (том 57)
 2010 (том 56)
 2009 (том 55)
 2008 (том 54)
 2007 (том 53)
 2006 (том 52)
 2005 (том 51)
 2004 (том 50)
 2003 (том 49)