1. Научно-исследовательский институт молекулярной биологии и биофизики, Новосибирск, Россия; Новосибирский государственный исследовательский университет, Новосибирск, Россия 2. Научно-исследовательский институт молекулярной биологии и биофизики, Новосибирск, Россия 3. Новосибирский государственный исследовательский университет, Новосибирск, Россия 4. Научно-исследовательский институт молекулярной биологии и биофизики, Новосибирск, Россия; Новосибирский государственный педагогический университет, Новосибирск, Россия
Исследовано влияние ксенобиотиков на экспрессию микроРНК в печени крыс. С этой целью с помощью биоинформатического анализа были отобраны микроРНК, способные взаимодействовать с 3'-нетранслируемой областью (3'-UTR) мРНК генов цитохрома Р450 (CYP) - три микроРНК (miR-21, -221, -222), потенциальными мишенями которых являются мРНК СYP1A1 и две микроРНК (miR-143, miR-152), действующие на мРНК CYP2B1. Методом ОТ-ПЦР в реальном времени определен уровень экспрессии данных микроРНК в печени крыс после обработки индукторами цитохрома Р450 CYP1A и CYP2B - бензо(а)пиреном (БП), фенобарбиталом (ФБ) и ДДТ. Содержание miR-21,-221,-222 в печени крыс, обработанных как БП, так и ДДТ, было в 2-3 раза ниже, чем у контрольных животных, а этоксирезоруфин-О-деэтилазная (ЭРОД) активность CYP1A1 - увеличена в 5,5-8,7 раза. Под действием ФБ экспрессия miR-143 не изменилась, а miR-152 увеличилась в 2 раза, тогда как пентоксирезоруфин-О-деэтилазная (ПРОД) активность CYP2B увеличилась в 10,5 раз. В печени крыс, обработанных ДДТ, активность ПРОД увеличилась в 20,8 раза, экспрессия miR-143 - в 2 раза, а miR-152 не изменилась. Биоинформатический анализ взаимодействий микроРНК-мишень показал, что отобранные микроРНК потенциально способны связывать такие мишени, как мРНК AhR, ESR1, GR, CCND1, PTEN. Таким образом, профиль экспрессии miR-21, -221, -222, -143, -152 может меняться в зависимости от применяемого индуктора CYP. Как показал анализ in silico, мишенями исследуемых микроРНК могут быть не только CYP1A/2B, но и другие гены, в том числе вовлечённые в гормональный канцерогенез
Гуляева Л.Ф., Чанышев М.Д., Колмыков С.К., Ушаков Д.С., Нечкин С.С. (2016) Эффект ксенобиотиков на экспрессию микроРНК в печени крыс. Биомедицинская химия, 62(2), 154-159.
Гуляева Л.Ф. и др. Эффект ксенобиотиков на экспрессию микроРНК в печени крыс // Биомедицинская химия. - 2016. - Т. 62. -N 2. - С. 154-159.
Гуляева Л.Ф. и др., "Эффект ксенобиотиков на экспрессию микроРНК в печени крыс." Биомедицинская химия 62.2 (2016): 154-159.
Гуляева, Л. Ф., Чанышев, М. Д., Колмыков, С. К., Ушаков, Д. С., Нечкин, С. С. (2016). Эффект ксенобиотиков на экспрессию микроРНК в печени крыс. Биомедицинская химия, 62(2), 154-159.
Переводная версия в журнале «Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:10.1134/S1990750816030033
Gailhouste L., Gomez-Santos L., Hagiwara K., Hatada I., Kitagawa N. (2013) Hepatology, 58(3), 1153-1165. CrossRef Scholar google search
Trajkovski M., Hausser J., Soutschek J., Bhat B., Akin A., Zavoaln M., Heim M.H., Stoffel M. (2013) Nature, 474, 649-653. CrossRef Scholar google search
Blanchette M., Kent J.W., Riemer C., Elnitski L., Smit A.F., Roskin K.M., Baertsch R., Rosenbloom K., Clawson H., Green E.D. (2004) Genome Res., 14, 708-715. CrossRef Scholar google search