Классификационные модели взаимосвязи структуры лекарственных соединений и их P-гликопротеиновой активности

   
Григорьев В.Ю.1 , Солодова С.Л.1, Полианчик Д.Е.1, Раевский О.А.1

1. Институт физиологически активных веществ Российской академии наук, Черноголовка, Россия
Раздел: Биоинформатика
DOI: 10.18097/PBMC20166202173      Идентификатор PubMed: 27143376
Год: 2016  том: 62  выпуск: 2  страницы: 173-179
С использованием методов линейного дискриминантного анализа, случайного леса и опорных векторов созданы 33 классификационные модели субстратной специфичности 177 лекарственных соединений по отношению к Р-гликопротеину. QSAR моделирование проведено с использованием двух стратегий. Первая стратегия заключалась в переборе всех возможных комбинаций из 1¸5 дескрипторов на основе 7 наиболее значимых молекулярных дескрипторов с ясной физико-химической интерпретацией. Во втором случае было использовано последовательное включение в модель до 5 дескрипторов, начиная с лучшего одиночного дескриптора. Эту стратегию применяли для набора из 387 DRAGON дескрипторов. В результате было установлено, что только одна из 33-х моделей обладает необходимыми статистическими параметрами. Данная модель была сконструирована с помощью метода линейного дискриминантного анализа на основе одиночного дескриптора Н-связи (SCad). Она имеет хорошие статистические характеристики, как внутренней кросс-валидацией, так и внешней валидацией с применением 44 новых соединений. Это подтверждает важную роль водородной связи в процессах, связанных с проникновением химических соединений через гематоэнцефалический барьер
Загрузить PDF:
Ключевые слова: QSAR, водородная связь, ГЭБ, P-гликопротеин, HYBOT
Дополнительные материалы:
Цитирование:

Григорьев, В. Ю., Солодова, С. Л., Полианчик, Д. Е., Раевский, О. А. (2016). Классификационные модели взаимосвязи структуры лекарственных соединений и их P-гликопротеиновой активности. Биомедицинская химия, 62(2), 173-179.
Список литературы  
 2020 (том 66)
 2019 (том 65)
 2018 (том 64)
 2017 (том 63)
 2016 (том 62)
 2015 (том 61)
 2014 (том 60)
 2013 (том 59)
 2012 (том 58)
 2011 (том 57)
 2010 (том 56)
 2009 (том 55)
 2008 (том 54)
 2007 (том 53)
 2006 (том 52)
 2005 (том 51)
 2004 (том 50)
 2003 (том 49)