МикроРНК – особый класс регуляторных молекул, влияющих на экспрессию генов. Циркулирующие микроРНК, которые обнаруживают в крови и других биологических жидкостях, рассматриваются сегодня как потенциальные биомаркеры патологий человека. К настоящему времени выявлены количественные изменения определённых циркулирующих микроРНК для большого числа онкологических и других заболеваний. Недавно появившийся метод цифровой капельной ПЦР (цкПЦР) обладает рядом преимуществ, которые делают его наиболее подходящим для верификации и валидации перспективных микроРНК-маркеров патологий человека. К этим преимуществам относятся: высокая точность и воспроизводимость результатов определения количества микроРНК, а также возможность прямого определения абсолютного количества копий микроРНК в широком динамическом диапазоне с высокой производительностью. В работе рассмотрены биогенез микроРНК, происхождение и методы количественной детекции циркулирующих микроРНК. Также рассмотрены технические особенности цкПЦР, которые делают её привлекательным методом для использования как в исследованиях микроРНК-маркеров различных патологий человека, так и в исследованиях, посвященных фундаментальным вопросам регуляции генной экспрессии молекулами микроРНК.
Киселева Я.Ю. и др. Цифровая капельная ПЦР – перспективный технологический подход к количественному профилированию микроРНК // Биомедицинская химия. - 2016. - Т. 62. -N 4. - С. 403-410.
Киселева Я.Ю. и др., "Цифровая капельная ПЦР – перспективный технологический подход к количественному профилированию микроРНК." Биомедицинская химия 62.4 (2016): 403-410.
Киселева, Я. Ю., Птицин, К. Г., Радько, С. П., Згода, В. Г., Арчаков, А. И. (2016). Цифровая капельная ПЦР – перспективный технологический подход к количественному профилированию микроРНК. Биомедицинская химия, 62(4), 403-410.
Переводная версия в журнале «Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:10.1134/S199075081601008X
Allegra A., Alonci A., Campo S., Penna G., Petrungaro A., Gerace D., Musolino C. (2012) Int. J. Oncol., 41, 1897-1912. Scholar google search
Cuk K., Zucknick M., Madhavan D., Schott S., Golatta M., Heil J., Marme F., Turchinovich A., Sinn P., Sohn C., Junkermann H., Schneeweiss A., Burwinkel B. (2013) PLoS One, 8, e76729. CrossRef Scholar google search
Fayyad-Kazan H., Bitar N., Najar M., Lewalle P., Fayyad-Kazan M., Badran R., Hamade E., Daher A., Hussein N., ElDirani R. et al. (2013) J. Transl. Med., 11, 31. CrossRef Scholar google search
Huang Y., Hu Q., Deng Z., Hang Y., Wang J., Wang K. (2014) Technol. Cancer Res. Treat., 13, 277-287. Scholar google search
Zampetaki A., Kiechl S., Drozdov I., Willeit P., Mayr U., Prokopi M., Mayr A., Weger S., Oberhollenzer F., Bonora E., Shah A., Willeit J., Mayr M. (2010) Circ. Res., 107, 810-817. CrossRef Scholar google search
Beyer C., Zampetaki A., Lin N.Y., Kleyer A., Perricone C., Iagnocco A., Distler A., Langley S. R., Gelse K., Sesselmann S. et al. (2015) Ann. Rheum. Dis., 74, e18. CrossRef Scholar google search
Weber J.A., Baxter D.H., Zhang S., Huang D.Y., Huang K.H., Lee M.J., Galas D.J., Wang K. (2010) Clin. Chem., 56, 1733-1741. CrossRef Scholar google search
Arroyo J.D., Chevillet J.R., Kroh E.M., Ruf I.K., Pritchard C.C., Gibson D.F., Mitchell P.S., Bennett C.F., Pogosova-Agadjanyan E.L., Stirewalt D.L., Tait J.F., Tewari M. (2011) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 108, 5003-5008. CrossRef Scholar google search
Mitchell P.S., Parkin R.K., Kroh E.M., Fritz B.R., Wyman S.K., Pogosova-Agadjanyan E.L., Peterson A., Noteboom J., O'Briant K.C., Allen A. et al. (2008) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 105, 10513-10518. CrossRef Scholar google search
Zernecke A., Bidzhekov K., Noels H., Shagdarsuren E., Gan L., Denecke B., Hristov M., Koppel T., Jahantigh M.N., Lutgens E., Wang S., Olson E.N., Schober A., Weber C. (2009) Sci. Signal., 2, ra81. CrossRef Scholar google search
Hergenreider E., Heydt S., Treguer K., Boettger T., Horrevoets A.J., Zeiher A.M., Scheffer M.P., Frangakis A.S., Yin X., Mayr M., Braun T., Urbich C., Boon R.A., Dimmeler S. (2012) Nat. Cell Biol., 14, 249-256. CrossRef Scholar google search
Zhang Y., Liu D., Chen X., Li J., Li L., Bian Z., Sun F., Lu J., Yin Y., Cai X. et al. (2010) Mol. Cell, 39, 133-144. CrossRef Scholar google search
Hunter M.P., Ismail N., Zhang X., Aguda B.D., Lee E.J., Yu L., Xiao T., Schafer J., Lee M.L., Schmittgen T.D., Nana-Sinkam S.P., Jarjoura D., Marsh C.B. (2008) PLoS One, 3, e3694. CrossRef Scholar google search
Catuogno S., Esposito C.L., Quintavalle C., Cerchia L., Condorelli G., De Franciscis V. (2011) Cancers (Basel), 3, 1877-1898. CrossRef Scholar google search
Mestdagh P., Hartmann N., Baeriswyl L., Andreasen D., Bernard N., Chen C., Cheo D., D'Andrade P., DeMayo M., Dennis L. et al. (2014) Nat. Methods, 11, 809-815. CrossRef Scholar google search
Linsen S.E., de Wit E., Janssens G., Heater S., Chapman L., Parkin R.K., Fritz B., Wyman S.K., de Bruijn E., Voest E.E., Kuersten S., Tewari M., Cuppen E. (2009) Nat. Methods, 6, 474-476. CrossRef Scholar google search
Tian G., Yin X., Luo H., Xu X., Bolund L., Zhang X., Gan S.Q., Li N. (2010) BMC Biotechnol., 10, 64. CrossRef Scholar google search
Sarkar D., Parkin R., Wyman S., Bendoraite A., Sather C., Delrow J., Godwin A.K., Drescher C., Huber W., Gentleman R., Tewari M. (2009) Nucleic Acids Res., 37, e17. CrossRef Scholar google search
Lawrie C.H., Gal S., Dunlop H.M., Pushkaran B., Liggins A.P., Pulford K., Banham A.H., Pezzella F., Boultwood J., Wainscoat J.S., Hatton C.S., Harris A. L. (2008) Br. J. Haematol., 141, 672-675. CrossRef Scholar google search
Chen X., Ba Y., Ma L., Cai X., Yin Y., Wang K., Guo J., Zhang Y., Chen J., Guo X. et al. (2008) Cell Res., 18, 997-1006. CrossRef Scholar google search
Skog J., Wurdinger T., van Rijn S., Meijer D.H., Gainche L., Sena-Esteves M., Curry W.T. Jr., Carter B.S., Krichevsky A.M., Breakefield X.O. (2008) Nat. Cell. Biol., 10, 1470-1476. CrossRef Scholar google search
Cuk K., Zucknick M., Heil J., Madhavan D., Schott S., Turchinovich A., Arlt D., Rath M., Sohn C., Benner A., Junkermann H., Schneeweiss A., Burwinkel B. (2013) Int. J. Cancer, 132, 1602-1612. CrossRef Scholar google search
Tijsen A.J., Creemers E.E., Moerland P.D., de Windt L.J., van der Wal A.C., Kok W.E., Pinto Y.M. (2010) Circ. Res., 106, 1035-1039. CrossRef Scholar google search
Goren Y., Kushnir M., Zafrir B., Tabak S., Lewis B.S., Amir O. (2012) Eur. J. Heart Fail., 14, 147-154. CrossRef Scholar google search
Dickinson B.A., Semus H.M., Montgomery R.L., Stack C., Latimer P.A., Lewton S.M., Lynch J.M., Hullinger T.G., Seto A.G., van Rooij E. (2013) Eur. J. Heart Fail., 15, 650-659. CrossRef Scholar google search
Cheng Y., Tan N., Yang J., Liu X., Cao X., He P., Dong X., Qin S., Zhang C. (2010) Clin. Sci. (Lond), 119, 87-95. CrossRef Scholar google search
Ai J., Zhang R., Li Y., Pu J., Lu Y., Jiao J., Li K., Yu B., Li Z., Wang R., Wang L., Li Q., Wang N., Shan H., Yang B. (2010) Biochem. Biophys. Res. Commun., 391, 73-77. CrossRef Scholar google search
Dorval V., Nelson P.T., Hebert S.S. (2013) Front. Mol. Neurosci., 6, 24. Scholar google search
