Редактирование матричной РНК аденозиндезаминазами ADAR: анализ на протеомном уровне

   
Ключникова А.А.1, Кузнецова К.Г.1, Мошковский С.А.2

1. Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича, Москва, Россия
2. Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича, Москва, Россия; Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н.И. Пирогова, Москва, Россия
Раздел: Обзор
DOI: 10.18097/PBMC20166205510      Идентификатор PubMed: 27797325
Год: 2016  том: 62  выпуск: 5  страницы: 510-519
Посттранскрипционное редактирование РНК специфичными аденозиндезаминазами ADAR, обнаруженное уже более двух десятилетий назад, обеспечивает дополнительную регуляцию транскриптома животных и человека. Преимущественно оно происходит в нервной ткани, причем в ходе реакции аденозин в особых участках РНК преобразуется в инозин. В случае мРНК остаток инозина распознается на рибосоме как гуанозин, что приводит к аминокислотным заменам при трансляции. Хотя такие замены влияют на функцию белков, например, субъединиц глутаматного рецептора, бóльшая часть работ по редактированию РНК, даже кодирующей белок, использует только анализ нуклеиновых кислот. В данном обзоре мы обосновываем необходимость использования панорамной протеомики, основанной на хромато-масс-спектрометрии высокого разрешения, для непосредственной оценки последствий редактирования РНК на белковом уровне. Разработанные в последние годы способы обработки больших массивов данных позволяют совместить результаты различных “омик”-подходов в так называемой протеогеномике. Предложенный протеогеномный подход для анализа последствий редактирования РНК на белковом уровне позволит непосредственно проводить качественный и количественный анализ отредактированных участков белков в масштабах протеома с изучением, в том числе, клинической значимости этого явления в патологиях нервной системы.
Загрузить PDF:
Ключевые слова: РНК-зависимая аденозиндезаминаза (АDAR), редактирование РНК, панорамная протеомика, протеогеномика
Цитирование:

Ключникова, А. А., Кузнецова, К. Г., Мошковский, С. А. (2016). Редактирование матричной РНК аденозиндезаминазами ADAR: анализ на протеомном уровне. Биомедицинская химия, 62(5), 510-519.
Переводная версия в журнале
«Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:
10.1134/S199075081701005X
Список литературы  
 2019 (том 65)
 2018 (том 64)
 2017 (том 63)
 2016 (том 62)
 2015 (том 61)
 2014 (том 60)
 2013 (том 59)
 2012 (том 58)
 2011 (том 57)
 2010 (том 56)
 2009 (том 55)
 2008 (том 54)
 2007 (том 53)
 2006 (том 52)
 2005 (том 51)
 2004 (том 50)
 2003 (том 49)