Изучение роли мутаций M182T и Q39K в структуре бета-лактамазы TEM-72 методом молекулярной динамики

   
Щербинин Д.С.1, Рубцова М.Ю.2, Григоренко В.Г.2, Упоров И.В.2, Веселовский А.В.1 , Егоров А.М.2

1. Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича, Москва, Россия
2. Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, Москва, Россия
Раздел: Биоинформатика
DOI: 10.18097/PBMC20166205527      Идентификатор PubMed: 27797327
Год: 2016  том: 62  выпуск: 5  страницы: 527-534
Синтез b-лактамаз является одним из наиболее общих механизмов резистентности бактерий к b-лактамным антибиотикам, таким как пенициллины и цефалоспорины. Широкое использование антибиотиков привело к возникновению множества вариантов b-лактамаз с расширенным спектром действия или устойчивым к ингибиторам. У b-лактамаз ТЕМ типа уже описаны мутации 92 аминокислотных остатков. Ряд мутаций являются функциональными и отвечают за расширение спектра субстратной специфичности. Однако роль большинства так называемых сопутствующих мутаций, расположенных вдали от активного центра, остаётся неизученной. В работе методом молекулярной динамики исследовали роль сопутствующих мутаций в структуре b-лактамаз ТЕМ-72, которая содержит две ключевые мутации (G238S, E240K) и две сопутствующие (Q39K, M182T). Показано, что появление ключевых мутаций остатков 238 и 240 приводило к дестабилизации белковой глобулы, что выражалось в увеличении подвижности аминокислотных остатков. Сопутствующие мутации остатков 182 и 39 влияли на структуру белка противоположным образом. Мутация M182T увеличивала устойчивость белковой глобулы, а мутация Q39K оказывала дестабилизирующий эффект. Эта мутация, по-видимому, способствует оптимизации конформационной подвижности b-лактамазы и может влиять на работу фермента.
Загрузить PDF:
Ключевые слова: бета-лактамаза, ТЕМ-1, ТЕМ-72, мутации, термоинактивация, молекулярная динамика
Цитирование:

Щербинин, Д. С., Рубцова, М. Ю., Григоренко, В. Г., Упоров, И. В., Веселовский, А. В., Егоров, А. М. (2016). Изучение роли мутаций M182T и Q39K в структуре бета-лактамазы TEM-72 методом молекулярной динамики. Биомедицинская химия, 62(5), 527-534.
Переводная версия в журнале
«Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:
10.1134/S1990750817020056
Список литературы  
 2019 (том 65)
 2018 (том 64)
 2017 (том 63)
 2016 (том 62)
 2015 (том 61)
 2014 (том 60)
 2013 (том 59)
 2012 (том 58)
 2011 (том 57)
 2010 (том 56)
 2009 (том 55)
 2008 (том 54)
 2007 (том 53)
 2006 (том 52)
 2005 (том 51)
 2004 (том 50)
 2003 (том 49)