Предсказание селективного торможения нейраминидазы вируса гриппа различных штаммов потенциальными ингибиторами

   
Микурова А.В.1 , Рыбина А.В.1, Скворцов В.С.1

1. Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича, Москва, Россия
Раздел: Экспериментальное исследование
DOI: 10.18097/PBMC20166206691      Идентификатор PubMed: 28026814
Год: 2016  том: 62  выпуск: 6  страницы: 691-703
Создана универсальная модель предсказания торможения нейраминидазы различных штаммах вируса гриппа заданным ингибитором. Она основана на известных данных о трёхмерной структуре (3D) нейраминидазы из различных штаммов вируса гриппа (A/Tokyo/3/67, A/tern/Australia/G70C/75, B/Lee/40), а также моделировании трёхмерной структуры нейраминидазы других штаммов (A/PR/8/34 и A/Aichi/2/68). С использованием докинга и молекулярной динамики были смоделированы 235 комплексов для лигандов с известными значениями IC50 для 185 соединений. Отбор конечных вариантов из трёх промежуточных для каждой пары белок/лиганд и расчёт независимых переменных для построения уравнений линейной регрессии выполнен с использованием MM-PBSA/MM-GBSA. В результате был получен набор уравнений, как для отдельных штаммов, так и уравнение, объединяющее все данные. Таким образом, результаты данной работы показывают реальную возможность предсказания степени ингибирования нейраминидазы для каждого из рассмотренных штаммов произвольным ингибитором и предсказать спектр его действия на различные варианты вируса гриппа.
Загрузить PDF:
Ключевые слова: нейраминидаза вируса гриппа, ингибиторы, вычислительные методы, QSAR
Цитирование:

Микурова, А. В., Рыбина, А. В., Скворцов, В. С. (2016). Предсказание селективного торможения нейраминидазы вируса гриппа различных штаммов потенциальными ингибиторами. Биомедицинская химия, 62(6), 691-703.
Переводная версия в журнале
«Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:
10.1134/S1990750817020044
Список литературы  
 2019 (том 65)
 2018 (том 64)
 2017 (том 63)
 2016 (том 62)
 2015 (том 61)
 2014 (том 60)
 2013 (том 59)
 2012 (том 58)
 2011 (том 57)
 2010 (том 56)
 2009 (том 55)
 2008 (том 54)
 2007 (том 53)
 2006 (том 52)
 2005 (том 51)
 2004 (том 50)
 2003 (том 49)