1. Федеральный научно-клинический центр физико-химической медицины, Москва, Россия 2. Санкт-Петербургский научно-исследовательский институт Фтизиопульмонологии, Санкт-Петербург, Россия 3. Федеральный научно-клинический центр физико-химической медицины, Москва, Россия; Московский физико-технический институт, Долгопрудный, Россия
С использованием безметочного LC-MS/MS подхода проведено сравнительное протеомное профилирование Micobacterium tuberculosis H37Rv, культивированного на двух разных питательных средах: Левенштейна-Йенсена и Миддлбрук 7H11. Показано, что результаты, получаемые на двух средах, обладают высокой сходимостью. Достоверное различие выявлено в представленности лишь для одного белка – фумаратредуктазы FrdB, представленность которой была выше в клетках микобактерий, культивированных на среде Левенштейна-Йенсена. Анализ корреляции биологических повторов выявил наибольшую сходимость на среде Миддлбрук 7Н11. Таким образом, полученные результаты позволяют сделать вывод, что использование среды Миддлбрук 7Н11 наиболее целесообразно в лабораторных условиях.
Загрузить PDF:
Ключевые слова: Mycobacterium tuberculosis, туберкулёз, протеомика, белки, условия культивирования
Цитирование:
Беспятых Ю.А., Маничева О.А., Смоляков А.В., Догонадзе М.З., Журавлев В.Ю., Шитиков Е.А., Ильина Е.Н. (2017) Влияние условий культивирования на протеомный профиль Mycobacterium tuberculosis H37RV. Биомедицинская химия, 63(4), 334-340.
Беспятых Ю.А. и др. Влияние условий культивирования на протеомный профиль Mycobacterium tuberculosis H37RV // Биомедицинская химия. - 2017. - Т. 63. -N 4. - С. 334-340.
Беспятых Ю.А. и др., "Влияние условий культивирования на протеомный профиль Mycobacterium tuberculosis H37RV." Биомедицинская химия 63.4 (2017): 334-340.
Беспятых, Ю. А., Маничева, О. А., Смоляков, А. В., Догонадзе, М. З., Журавлев, В. Ю., Шитиков, Е. А., Ильина, Е. Н. (2017). Влияние условий культивирования на протеомный профиль Mycobacterium tuberculosis H37RV. Биомедицинская химия, 63(4), 334-340.
Переводная версия в журнале «Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:10.1134/S1990750818010031
Список литературы
WHO (2016) Global Tuberculosis Report, 13, 13-14, ISBN 978 92 4 156539 4. Scholar google search
Treitz C., Enjalbert B., Portais J.-C., Letisse F., Tholey A. (2016) Proteomics, 16, 2742-2746. CrossRef Scholar google search
Abuali M.M., Katariwala R., LaBombardi V.J. (2012) Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis., 31(5), 835-839. CrossRef Scholar google search
Hall L., Jude K.P., Clark S.L., Wengenack N.L. (2011) J. Vis. Exp., 52, pii: 3094. Scholar google search
Hall L., Jude K.P., Clark S.L., Dionne K., Merson R., Boyer A. (2012) J. Clin. Microbiol., 50(11), 3732-3734. CrossRef Scholar google search
Faburay A.K., Mendy F.S., Otu J.K., Faal-Jawara T.I., Gehre F., Secka O. (2016) Int. J. Mycobacteriol., 5, Suppl 1:S169. CrossRef Scholar google search
Joloba M.L., Johnson J.L., Feng P.J., Bozeman L., Goldberg S.V., Morgan K., Gitta P., Boom H.W., Heilig C.M., Mayanja-Kizza H., Eisenach K.D. (2014) Tuberculosis (Edinb.), 94, 311-316. CrossRef Scholar google search
Jungblut P.R., Schaible U.E., Mollenkopf H.J., Zimny-Arndt U., Raupach B. (1999) Mol. Microbiol., 33(6), 1103-1117. CrossRef Scholar google search
Беспятых Ю.А. (2016) Геномная и протеомная характеристика штаммов Mycobacterium tuberculosis кластера Beijing B0/W148. Дисс. канд. наук. НИИбиомедицинской химии им. В.Н.Ореховича, Москва. Scholar google search
Shevchenko A., Tomas H., Havlis J., Olsen J.V., Mann M. (2006) Nat. Protoc., 1(6), 2856-2860. CrossRef Scholar google search
Bespyatykh J., Shitikov E., Butenko I., Altukhov I., Alexeev D., Mokrousov I., Dogonadze M., Zhuravlev V., Yablonsky P., Ilina E. (2016) Sci Rep., 6, 28985. CrossRef Scholar google search
Benjamini Y., Hochberg Y. (1995) J. Royal Statistic. Society, Series B (Methodological), 57, 289-300. Scholar google search
Schubert O.T., Mouritsen J., Ludwig C., Rost H.L., Rosenberger G. (2013) Cell Host Microbe., 13(5), 602-612. CrossRef Scholar google search
de Keijzer J., de Haas P.E., de Ru A.H., van Veelen P.A., van Soolingen D. (2014) Mol. Cell Proteomics, 13(10), 2632-2645. CrossRef Scholar google search
Lu X., Sun J., Nimtz M., Wissing J., Zeng A-P., Rinas U. (2010) Microb. Cell, 9(23), DOI: 10.1186/1475-2859-9-23. CrossRef Scholar google search
Caglar M.U., Houser J.R., Barnhart C.S., Boutz D.R., Carroll S.M., Dasgupta A., Lenoir W.F., Smith B.L., Sridhara V., Sydykova D.K., Vander Wood D., Marx C.J., Marcotte E.M., Barrick J.E., Wilke C.O. (2017) Sci. Rep., 7, 45303. CrossRef Scholar google search
Наумова Е.С. (1984) Образование биотина различными группами микроорганизмов и некоторые аспекты его регуляции. Дисс. канд. наук. МГУ им. Ломоносова, Москва. Scholar google search
