1. Санкт-Петербургский государственный технологический институт, Санкт-Петербург, Россия 2. ООО “Криотек”, Москва, Россия 3. “ASKION” GmbH, Gewerbepark, Gera, Германия
Биобанки представляют собой систематизированные и аннотированные коллекции биологических образцов, имеющие систему СОП – стандартных операционных процедур – и соответствующие рекомендациям ISBER – Международного общества биологических и экологических репозиториев. Определяющее значение в деятельности биобанка имеет стандартизация условий получения, обработки, хранения и предоставления образцов конечному пользователю. Атрибутами биобанка являются общие принципы маркирования и аннотирования биологических образцов с использованием специализированного ПО, автоматизированные системы контроля условий их хранения и учёта. Криобанки представляют собой биобанки с наличием условий хранения от -196°C до -150°C, что позволяют обеспечить лучшую жизнеспособность клеток и наибольшую сохранность биологических молекул. Криобанкирование является наиболее существенной частью инфраструктуры персонализованной и популяционной медицины, фармацевтики и биофармакологии, сохранения редких и исчезающих видов, биотехнологий в целом. Биобанкирование следующего поколения – Next Generation Biobanking – концепция, специально разработанная для омиксных технологий, включает в себя аннотирование биологических образцов по большому числу биомаркеров на основе технологий секвенирования нового поколения – Next Generation Sequencing, а также наличие нескольких временных точек сбора биологического материала у одного и того же пациента (например, на разных стадиях заболевания, до и после операции, в разные периоды терапии) с подробной аннотацией физиологических, биохимических и клинических данных. Большое значение в биобанкировании следующего поколения имеют эпигенетические исследования (метилирование ДНК, микроРНК и т.д.), а также анализ биоинформационных данных. Такие биобанки должны функционировать на основе новых этических принципов постгеномной эры.
Загрузить PDF:
Ключевые слова: биобанки, криобанки, аннотирование, контроль условий хранения, жизнеспособность клеток, сохранность биологических молекул
Цитирование:
Сазанов А.А., Ерганоков Х.Х., Пфайфер Э. (2017) Криобанк как атрибут омиксных технологий. Биомедицинская химия, 63(5), 428-431.
Сазанов А.А. и др. Криобанк как атрибут омиксных технологий // Биомедицинская химия. - 2017. - Т. 63. -N 5. - С. 428-431.
Сазанов А.А. и др., "Криобанк как атрибут омиксных технологий." Биомедицинская химия 63.5 (2017): 428-431.
Сазанов, А. А., Ерганоков, Х. Х., Пфайфер, Э. (2017). Криобанк как атрибут омиксных технологий. Биомедицинская химия, 63(5), 428-431.
Список литературы
Сазанов А.А., Пфайфер Э., Ерганоков А.Х. (2017) Справочник заведующего КДЛ, 7, 33-41. Scholar google search
Harris J.R., Burton P., Knoppers B.M., Lindpaintner K., Bledsoe M., Brookes A.J., Budin-Ljøsne I., Chisholm R., Cox D., Deschênes M. et al. (2012) Eur. J. Hum. Genet., 20, 1105-1111. CrossRef Scholar google search
Best Practices for Repositories: Collection, Storage, Retrieval and Distribution of Biological Materials for Research. Third Edition (2012) Biopreservation and Biobanking, 10, 79-161. Scholar google search
Brochhausen M., Zheng J., Birtwell D., Williams H., Masci A.M., Ellis H.J., Stoeckert C. (2016) J. Biomed. Semantics, 7, 23-32. CrossRef Scholar google search
Biobanking in the 21st century (2015) in Series: Advances in experimental medicine and biology (Karimi-Busheri F., ed.), Springer, 864, 186 p. Scholar google search
Ethics, law and governance of biobanking: national, European, and international approaches (2015) in Series: International library of ethics, law and technology (Mascalzoni D., ed.), Springer, 14, 277 p. Scholar google search
Pfeifer E., Werner A. (2016) in: Refrigeration Science and Technology Proceedings. Institut für Luft und Kältetechnik Gemeinnützige Gesellschaft mbH, Dresden, pp. 57-60. Scholar google search