Увеличение доли лекарственно-устойчивых штаммов бактерий непосредственно связано с широким применением антибиотиков в медицине и животноводстве. Предполагается, что микрофлора кишечника служит резервуаром генов антибиотикорезистентности, которые могут передаваться от симбиотических бактерий к патогенным микроорганизмам, в том числе в результате фаговой трансдукции. С использованием программы предсказания профагов PHASTER и базы данных генов антибиотикорезистентности CARD проведён поиск генов антибиотикорезистентности, находящихся в составе профагов, в микробном сообществе кишечника человека. В результате анализа метагеномных сборок восьми образцов в составе последовательностей профагов были обнаружены гены lsaE, mdfA и cpxR/cpxA, присутствие которых обеспечивает устойчивость бактерий к антимикробным пептидам, плевромутилину, линкомицинам, стрептограминам группы А, а также множественную лекарственную устойчивость. Из 659 предположительных профагов, предсказанных в метагеномных сборках, три (0,46%) имели в своём составе гены антибиотикорезистентности.
Старикова Е.В., Пряничников Н.А., Здобнов Е., Говорун В.М. (2017) Биоинформатический анализ колокализации генов резистентности и профагов в метагеномах кишечника человека. Биомедицинская химия, 63(6), 508-512.
Старикова Е.В. и др. Биоинформатический анализ колокализации генов резистентности и профагов в метагеномах кишечника человека // Биомедицинская химия. - 2017. - Т. 63. -N 6. - С. 508-512.
Старикова Е.В. и др., "Биоинформатический анализ колокализации генов резистентности и профагов в метагеномах кишечника человека." Биомедицинская химия 63.6 (2017): 508-512.
Старикова, Е. В., Пряничников, Н. А., Здобнов, Е., Говорун, В. М. (2017). Биоинформатический анализ колокализации генов резистентности и профагов в метагеномах кишечника человека. Биомедицинская химия, 63(6), 508-512.
Переводная версия в журнале «Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:10.1134/S1990750818020129
Appelt S., Fancello L., Le Bailly M., Raoult D., Drancourt M., Desnues C.C. (2014) Appl. Environ. Microbiol., 80, 2648-2655. CrossRef Scholar google search
Weatherspoon-Griffin N., Zhao G., Kong W., Kong Y., Morigen, Andrews-Polymenis H. et al. (2011) J. Biol. Chem., 286, 5529–5539. CrossRef Scholar google search
Weatherspoon-Griffin N., Yang D., Kong W., Hua Z., Shi Y. (2014) J. Biol. Chem., 289, 32571-32582. CrossRef Scholar google search
