Применение ДНК-аптамеров для обогащения низкопредставленных белков в клеточных экстрактах для количественной детекции методом мониторинга выбранных реакций

   
Птицын К.Г.1, Новикова С.Е.1, Киселёва Я.Ю.2, Мойса А.А.1, Курбатов Л.К.1, Фарафонова Т.Е.1, Радько С.П.1 , Згода В.Г.1, Арчаков А.И.1

1. Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича, Москва, Россия
2. Российский научный центр рентгенорадиологии, Москва, Россия
Раздел: Экспериментальное исследование
DOI: 10.18097/PBMC20186401005      Идентификатор PubMed: 29460828
Год: 2018  том: 64  выпуск: 1  страницы: 5-9
В работе исследовано соотношение между количеством белковой мишени (таргетного белка) в сложном биологическом образце и его количеством, определяемым масс-спектрометрическим методом мониторинга выбранных реакций (МВР) при аффинном обогащении таргетного белка с использованием аптамеров, иммобилизованных на твёрдой фазе. Тромбин человека, добавленный в известных концентрациях к клеточным экстрактам, полученным из бактериальных клеток, был использован как модельный таргетный белок. Показано, что аффинное обогащение тромбина в клеточных экстрактах с помощью тромбин-связывающего аптамера, иммобилизованного на поверхности магнитных микросфер, приводит приблизительно к 10-кратному увеличению концентрации таргетного белка и 100-кратному снижению нижнего значения диапазона концентраций, в котором возможна его количественная детекция методом МВР без существенной интерференции со стороны других пептидов, присутствующих в триптическом гидролизате.
Загрузить PDF:
Ключевые слова: аптамеры, тромбин, обогащение, количественная детекция, мониторинг выбранных реакций
Цитирование:

Птицын, К. Г., Новикова, С. Е., Киселёва, Я. Ю., Мойса, А. А., Курбатов, Л. К., Фарафонова, Т. Е., Радько, С. П., Згода, В. Г., Арчаков, А. И. (2018). Применение ДНК-аптамеров для обогащения низкопредставленных белков в клеточных экстрактах для количественной детекции методом мониторинга выбранных реакций. Биомедицинская химия, 64(1), 5-9.
Переводная версия в журнале
«Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:
10.1134/S1990750818020105
Список литературы  
 2020 (том 66)
 2019 (том 65)
 2018 (том 64)
 2017 (том 63)
 2016 (том 62)
 2015 (том 61)
 2014 (том 60)
 2013 (том 59)
 2012 (том 58)
 2011 (том 57)
 2010 (том 56)
 2009 (том 55)
 2008 (том 54)
 2007 (том 53)
 2006 (том 52)
 2005 (том 51)
 2004 (том 50)
 2003 (том 49)