1. Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича, Москва, Россия; Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н.И. Пирогова, Москва, Россия
Обзор посвящен современным методам определения функциональной активности изоферментов цитохрома Р450, таким как абсорбционная и флуоресцентная спектроскопия, электронный парамагнитный резонанс (ЭПР), ядерный магнитный резонанс (ЯМР), спектроскопия комбинационного рассеяния (рамановская спектроскопия), мёссбауэровская спектроскопия, рентгеновская спектроскопия, метод поверхностного плазмонного резонанса (SPR), атомно-силовая микроскопия (AFM). Методы молекулярно-генетического анализа проанализированы с позиций персонализированной медицины. Обсуждены возможности хромато-масс-спектрометрических методов для анализа продуктов цитохром Р450-зависимых каталитических реакций. В обзоре рассмотрены современные электрохимические системы на основе изоферментов цитохрома Р450 для анализа их каталитической активности, обсуждаются практическое применение и дальнейшие перспективы их развития для экспериментальной фармакологии, биотехнологии, трансляционной медицины.
Кузиков А.В., Масамрех Р.А., Арчаков А.И., Шумянцева В.В. (2018) Методы определения функциональной активности изоферментов цитохрома P450. Биомедицинская химия, 64(2), 149-168.
Кузиков А.В. и др. Методы определения функциональной активности изоферментов цитохрома P450 // Биомедицинская химия. - 2018. - Т. 64. -N 2. - С. 149-168.
Кузиков А.В. и др., "Методы определения функциональной активности изоферментов цитохрома P450." Биомедицинская химия 64.2 (2018): 149-168.
Кузиков, А. В., Масамрех, Р. А., Арчаков, А. И., Шумянцева, В. В. (2018). Методы определения функциональной активности изоферментов цитохрома P450. Биомедицинская химия, 64(2), 149-168.
Переводная версия в журнале «Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:10.1134/S1990750818030046
Список литературы
Archakov A.I., Bachmanova G.I. (1990) Cytochrome P-450 and active oxygen, Taylor & Francis Group, London. Scholar google search
Korošec T., Ačimovič J., Seliškar M., Kocjan D., Tacer K.F., Rozman D., Urleb U. (2008) Bioorganic Med. Chem., 16, 209-221. CrossRef Scholar google search
Ortiz de Montellano P.R. (2015) in: Cytochrome P450. Structure, Mechanism, and Biochemistry (Ortiz de Montellano P.R., ed.), University of California, San Francisco, California, USA, pp. 111-176. CrossRef Scholar google search
Guengerich F.P. (2015) in: Cytochrome P450. Structure, Mechanism, and Biochemistry (Ortiz de Montellano P.R., ed.), Springer International Publishing, Switzerland, pp. 523-785. Scholar google search
Estabrook R.W., Cooper D.Y., Rosenthal O. (1963) Biochem. Z., 338, 741-755. Scholar google search
Poulos T.L., Johnson E.F. (2015) in: Cytochrome P450. Structure, Mechanism, and Biochemistry (Ortiz de Montellano P.R., ed.), Springer International Publishing, Switzerland, pp. 3-32. Scholar google search
Waskell L., Kim J.-J.P. (2015) in: Cytochrome P450. Structure, Mechanism, and Biochemistry (Ortiz de Montellano P.R., ed.), Springer International Publishing, Switzerland, pp. 33-68. Scholar google search
Yamazaki H., Shimada T. (2006) in: Cytochrome P450 Protocols (Phillips I.R., Elizabeth A.S., eds.), Humana Press Inc., Totowa, New Jersey, USA, pp. 61-72. Scholar google search
Nazarov P.A., Drutsa V.L., Miller W.L., Shkumatov V.M., Luzikov V.N., Novikova L.A. (2003) DNA Cell Biol., 22, 243-252. CrossRef Scholar google search
Khatri Y., Ringle M., Lisurek M., VonKries J.P., Zapp J., Bernhardt R. (2016) ChemBioChem, 17, 90-101. CrossRef Scholar google search
Baravalle R., Di Nardo G., Bandino A., Barone I., Catalano S., Andt S., Gilardi G. (2017) J. Steroid Biochem. Mol. Biol., 167, 23-32. CrossRef Scholar google search
Baravalle R., Ciaramella A., Baj F., Di Nardo G., Gilardi G. (2018) BBA Proteins Proteomics, 1866, 88-96. CrossRef Scholar google search
Luthra A., Gregory M., Grinkova Y.V., Denisov I.G., Sligar S.G. (2013) in: Cytochrome P450 Protocols (Phillips I.R., Shephard E.A., Ortiz de Montellano P.R., eds.), Humana Press Inc., New York, pp. 115-128. Scholar google search
Sevrioukova I.F., Poulos T.L. (2015) in: Monooxygenase, Peroxidase and Peroxygenase Properties and Mechanisms of Cytochrome P450 (Hrycay E.G., Bandiera S.M., eds.), Springer International Publishing, Cham, pp. 83-105. Scholar google search
Remmer H., Schenkman J., Estabrook R.W., Sasame H., Gillette J., Narasimhulu S., Cooper D.Y., Rosenthal O. (1966) Mol. Pharmacol., 2, 187-190. Scholar google search
Schenkman J.B., Cinti D.L., Orrenius S., Moldeus P., Kraschnitz R. (1972) Biochemistry, 11, 4243-4251. CrossRef Scholar google search
von Kries J.P., Warrier T., Podust L.M. (2010) Current Protocols in Microbiology, John Wiley & Sons, Inc., pp. 16:17.4:17.4.1–17.4.25. Scholar google search
Simgen B., Contzen J., Schwarzer R., Bernhardt R., Jung C. (2000) Biochem. Biophys. Res. Commun., 269, 737-742. CrossRef Scholar google search
Khatri Y., Hannemann F., Girhard M., Kappl R., Même A., Ringle M., Janocha S., Leize-Wagner E., Urlacher V.B., Bernhardt R. (2013) Biotechnol. Appl. Biochem., 60, 18-29. CrossRef Scholar google search
Kunze K.L., Nelson W.L., Kharasch E.D., Thummel K.E., Isoherranen N. (2006) Drug Metab. Dispos., 34, 583-590. CrossRef Scholar google search
Pearson J.T., Hill J.J., Swank J., Isoherranen N., Kunze K.L., Atkins W.M. (2006) Biochemistry, 45, 6341-6353. CrossRef Scholar google search
Kenaan C., Zhang H., Hollenberg P.F. (2013) in: Cytochrome P450 Protocols (Phillips I.R., Shephard E.A., Ortiz de Montellano P.R., eds.), Springer Science+Business Media, New York, pp. 61-69. Scholar google search
Sharrock M., Münck E., Debrunner P.G., Marshall V., Lipscomb J.D., Gunsalus I.C. (1973) Biochemistry, 12, 258-265. CrossRef Scholar google search
Sharrock M., Debrunner P.G., Schulz C., Lipscomb J.D., Marshall V., Gunsalus I.C. (1976) BBA Protein Struct., 420, 8-26. CrossRef Scholar google search
Martinho M., Münck E. (2010) in: Physical Inorganic Chemistry: Principles, Methods, and Models (Bakac A., ed.) John Wiley & Sons, Inc., New York, pp. 39-67. CrossRef Scholar google search
Smith D., Sadagopan N., Zientek M., Reddy A., Cohen L. (2007) J. Chromatogr. B, Anal. Technol. Biomed. Life Sci., 850, 455-463. CrossRef Scholar google search
Li X., Chen X., Li Q., Wang L., Zhong D. (2007) J. Chromatogr. B, Anal. Technol. Biomed. Life Sci., 852, 128-137. CrossRef Scholar google search
Yao M., Zhu M., Sinz M.W., Zhang H., Humphreys W.G., Rodrigues A.D., Dai R. (2007) J. Pharm. Biomed. Anal., 44, 211-223. CrossRef Scholar google search
Tolonen A., Petsalo A., Turpeinen M., Uusitalo J., Pelkonen O. (2007) J. Mass Spectrom., 42, 960-966. CrossRef Scholar google search
O’Donnell C.J., Grime K., Courtney P., Slee D., Riley R.J. (2007) Drug Metab. Dispos., 35, 381-385. CrossRef Scholar google search
Yan Z., Caldwell G.W. (2014) in: Optimization in Drug Discovery: In Vitro Methods (Caldwell G.W., Yan Z., eds.), Humana Press, Totowa, NJ, pp. 477-488. CrossRef Scholar google search
Frei R.W., Watson I.D., Stewart M.J., Prescott L.F., King I.S., Brown L., Balali M., Adriaenssens P.I., Dixon P.F., Lukha P. et al. (1979) Proc. Anal. Div. Chem. Soc., 16, 289-307. CrossRef Scholar google search
Yablokov E., Florinskaya A., Medvedev A., Sergeev G., Strushkevich N., Luschik A., Shkel T., Haidukevich I., Gilep A., Usanov S. et al. (2017) Arch. Biochem. Biophys., 619, 1015. CrossRef Scholar google search
Иванов А.С., Згода В.Г., Арчаков А.И. (2011) Биоорган. химия, 37, 8-21. Scholar google search
Sadee W., Wang D., Papp A.C., Pinsonneault J.K., Smith R.M., Moyer R.A., Johnson A.D. (2011) Clin. Pharmacol. Ther., 89, 355-365. CrossRef Scholar google search
Hagen K.D., Gillan J.M., Im S.-C., Landefeld S., Mead G., Hiley M., Waskell L.A., Hill M.G., Udit A.K. (2013) J. Inorg. Biochem., 129, 30-34. CrossRef Scholar google search
Frank R., Klenner M., Azendorf R., Bartz M., Jahnke H.G., Robitzki A.A. (2017) Biosens. Bioelectron., 93, 322-329. CrossRef Scholar google search
Mi L., He F., Jiang L., Shangguan L., Zhang X., Ding T., Liu A., Zhang Y., Liu S. (2017) J. Electroanal. Chem., 804, 23-28. CrossRef Scholar google search
Shukla A., Gillam E.M., Mitchell D.J., Bernhardt P.V. (2005) Electrochem. commun., 7, 437-442. CrossRef Scholar google search
Girhard M., Bakkes P.J., Mahmoud O., Urlacher V.B. (2015) in: Cytochrome P450: Structure, Mechanism, and Biochemistry (Ortiz de Montellano P.R., ed.), Springer International Publishing, Cham, pp. 451-520. Scholar google search