Основная масса белков в живых системах функционирует не изолированно, а в составе разнообразных белковых комплексов. Использование широкого спектра протеомных методик в последние годы значительно расширило понимание функционирования не только индивидуальных белков, но и заложило основы системного анализа белок-белковых взаимодействий. Наша работа посвящена анализу интерактома белков печени человека с применением гель-фильтрации, совмещённой с масс-спектрометрией. В шести выбранных фракциях лизата ткани печени человека со средними молекулярными массами 45 кДа, 60 кДа, 85 кДа, 150 кДа, 250 кДа, 440 кДа было идентифицировано всего 797 белков. В зависимости от профиля распределения по фракциям все идентифицированные белки можно разделить на четыре группы: (1) одиночные белки, находящиеся в мономолекулярном состоянии и не участвующие в формировании стабильных белковых комплексов; (2) белки, существующие в виде гомодимеров или гетеродимеров с соразмерными с ними партнерами; (3) белки, находящиеся частично в мономолекулярном состоянии, частично – в составе белковых комплексов; (4) белки, не существующие в мономолекулярном состоянии, а находящиеся только в составе белковых комплексов с числом субъединиц 3 и более. Применение данного подхода к ранее известным изатин-связывающим белкам позволило выделить такие белки, которые участвуют как в формировании гомо- и гетеродимеров, так и сложных комплексов.
Флоринская А.В., Ершов П.В., Мезенцев Ю.В., Калужский Л.А., Яблоков Е.О., Бунеева О.А., Згода В.Г., Медведев А.Е., Иванов А.С. (2018) Анализ участия индивидуальных белков в формировании белкового интерактома. Биомедицинская химия, 64(2), 169-174.
Флоринская А.В. и др. Анализ участия индивидуальных белков в формировании белкового интерактома // Биомедицинская химия. - 2018. - Т. 64. -N 2. - С. 169-174.
Флоринская А.В. и др., "Анализ участия индивидуальных белков в формировании белкового интерактома." Биомедицинская химия 64.2 (2018): 169-174.
Флоринская, А. В., Ершов, П. В., Мезенцев, Ю. В., Калужский, Л. А., Яблоков, Е. О., Бунеева, О. А., Згода, В. Г., Медведев, А. Е., Иванов, А. С. (2018). Анализ участия индивидуальных белков в формировании белкового интерактома. Биомедицинская химия, 64(2), 169-174.
Переводная версия в журнале «Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:10.1134/S1990750818030034
Список литературы
Иванов А.С, Згода В.Г., Арчаков А.И. (2011) Биоорган. химия, 37(1), 8-21. Scholar google search
Azarkan M., Huet J., Baeyens-Volant D., Looze Y. (2007) J. Chromatogr. B, Analytical Technologies in the Biomedical and Life Sciences, 849, 81-90. CrossRef Scholar google search
Ivanov A., Medvedev A., Ershov P., Molnar A., Mezentsev Y., Yablokov E., Kaluzhsky L., Gnedenko O., Buneeva O., Haidukevich I., Sergeev G., Lushchyk A., Yantsevich A., Medvedeva M., Kozin S., Popov I., Novikova S., Zgoda V., Gilep A., Usanov S., Lisitsa A., Archakov A. (2014) Proteomics, 14, 2261-2274. CrossRef Scholar google search
Havugimana P., Hart G., Nepusz T., Yang H., Turinsky A., Li Z., Wang P., Boutz D., Fong V., Phanse S., Babu M., Craig S., Hu P., Wan C., Vlasblom J., Dar V., Bezginov A., Clark G., Wu G., Wodak S., Tillier E., Paccanaro A., Marcotte E., Emili A. (2012) Cell, 150, 1068-1081. CrossRef Scholar google search
Wan C., Liu J., Fong V., Lugowski A., Stoilova S., Bethune-Waddell D., Borgeson B., Havugimana P.C., Marcotte E.M., Emili A. (2013) Proteomics, 81, 102-111. CrossRef Scholar google search
Kirkwood K., Ahmad Y., Larance M., Lamond A. (2013) Molecular Cellular Proteomics, 12, 3851-3873. CrossRef Scholar google search
Демина И., Серебрякова М., Ладыгина В., Рогова М., Згода В., Корженевский Д., Говорун В. (2009) Биохимия, 74(2), 205-215. Scholar google search
Gnedenko O., Yablokov E., Usanov S., Mukha D., Sergeev G., Bulko T., Kuzikov A., Moskaleva N., Shumyantseva V., Ivanov A.,Archakov A. (2014) Chem. Phys. Letts., 593, 40-44. CrossRef Scholar google search
Иванов А., Ершов П., Мольнар А., Мезенцев Ю., Калужский Л., Яблоков Е., Флоринская А., Гнеденко О., Медведев А., Козин С., Митькевич В., Макаров А., Гилеп А., Лущик А., Гайдукевич И., Усанов С. (2016) Биоорган. химия, 42, 28-35. CrossRef Scholar google search
Ershov P., Mezentsev Y., Gilep A., Usanov S., Buneeva O., Medvedev A., Ivanov A. (2017) Protein Sci., 26(12), 2458-2462. CrossRef Scholar google search
Buneeva O., Gnedenko O., Zgoda V., Kopylov A., Glover V., Ivanov A., Medvedev A., Archakov A. (2010) Proteomics, 10(1), 23-37. CrossRef Scholar google search
