Анализ участия индивидуальных белков в формировании белкового интерактома

   
Флоринская А.В.1 , Ершов П.В.1, Мезенцев Ю.В.1, Калужский Л.А.1, Яблоков Е.О.1, Бунеева О.А.1, Згода В.Г.1, Медведев А.Е.1, Иванов А.С.1

1. Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича, Москва, Россия
Раздел:
DOI: 10.18097/PBMC20186402169      Идентификатор PubMed: 29723146
Год: 2018  том: 64  выпуск: 2  страницы: 169-174
Основная масса белков в живых системах функционирует не изолированно, а в составе разнообразных белковых комплексов. Использование широкого спектра протеомных методик в последние годы значительно расширило понимание функционирования не только индивидуальных белков, но и заложило основы системного анализа белок-белковых взаимодействий. Наша работа посвящена анализу интерактома белков печени человека с применением гель-фильтрации, совмещённой с масс-спектрометрией. В шести выбранных фракциях лизата ткани печени человека со средними молекулярными массами 45 кДа, 60 кДа, 85 кДа, 150 кДа, 250 кДа, 440 кДа было идентифицировано всего 797 белков. В зависимости от профиля распределения по фракциям все идентифицированные белки можно разделить на четыре группы: (1) одиночные белки, находящиеся в мономолекулярном состоянии и не участвующие в формировании стабильных белковых комплексов; (2) белки, существующие в виде гомодимеров или гетеродимеров с соразмерными с ними партнерами; (3) белки, находящиеся частично в мономолекулярном состоянии, частично – в составе белковых комплексов; (4) белки, не существующие в мономолекулярном состоянии, а находящиеся только в составе белковых комплексов с числом субъединиц 3 и более. Применение данного подхода к ранее известным изатин-связывающим белкам позволило выделить такие белки, которые участвуют как в формировании гомо- и гетеродимеров, так и сложных комплексов.
Загрузить PDF:
Ключевые слова: белок-белковые взаимодействия, белковая интерактомика, высокоэффективная гель-хроматография, белковая масс-спектрометрия, системный анализ
Цитирование:

Флоринская, А. В., Ершов, П. В., Мезенцев, Ю. В., Калужский, Л. А., Яблоков, Е. О., Бунеева, О. А., Згода, В. Г., Медведев, А. Е., Иванов, А. С. (2018). Анализ участия индивидуальных белков в формировании белкового интерактома. Биомедицинская химия, 64(2), 169-174.
Список литературы  
 2019 (том 65)
 2018 (том 64)
 2017 (том 63)
 2016 (том 62)
 2015 (том 61)
 2014 (том 60)
 2013 (том 59)
 2012 (том 58)
 2011 (том 57)
 2010 (том 56)
 2009 (том 55)
 2008 (том 54)
 2007 (том 53)
 2006 (том 52)
 2005 (том 51)
 2004 (том 50)
 2003 (том 49)