1. Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук, Томск, Россия; Сибирский государственный медицинский университет, Томск, Россия 2. Научно-исследовательский институт медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук, Томск, Россия 3. Сибирский государственный медицинский университет, Томск, Россия 4. Научно-исследовательский институт кардиологии, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии наук, Томск, Россия
С использованием микрочипов HumanHT-12 BeadChip (“Illumina”, США) проведён сравнительный полногеномный анализ экспрессии генов в клетках сонных артерий, пораженных атеросклерозом, и клетках интактных внутренних грудных артерий у пациентов с клинически выраженным атеросклерозом на поздних стадиях патологического процесса. Существенное снижение уровня экспрессии в клетках сонных артерий, поражённых атеросклерозом, по сравнению с интактными внутренними грудными артериями, выявлено для генов APOD, FABP4, CIDEC и FOSB, а увеличение экспрессии – для гена SPP1 (|FC|>64; pFDR<0,05). В клетках атеросклеротически пораженных артерий по сравнению с интактными сосудами выявлено преобладание доли генов со сниженной функциональной активностью. В частности, выявлено снижение экспрессии генов иммуновоспалительного ответа (метаболизм арахидоновой кислоты, взаимодействие “цитокин-цитокиновый рецептор”, сигнальные пути NOD-подобных рецепторов, Jak-STAT и TNF). Наиболее значимыми биологическими процессами, в которых участвуют белковые продукты генов со снижением экспрессии в атеросклеротически пораженных сонных артериях по сравнению с интактными внутренними грудными артериями, являются ответы клетки на действие ионов металлов (металлотионеины), а для белковых продуктов генов с увеличением экспрессии в атеросклеротически измененных артериях - организация внеклеточного матрикса.
Назаренко М.С., Марков А.В., Слепцов А.А., Королёва Ю.А., Шарыш Д.В., Зарубин А.А., Валиахметов Н.Р., Гончарова И.А., Муслимова Э.Ф., Кузнецов М.С., Козлов Б.Н., Афанасьев С.А., Пузырев В.П. (2018) Сравнительный анализ экспрессии генов в клетках сосудов у больных с клинически выраженным атеросклерозом. Биомедицинская химия, 64(5), 416-422.
Назаренко М.С. и др. Сравнительный анализ экспрессии генов в клетках сосудов у больных с клинически выраженным атеросклерозом // Биомедицинская химия. - 2018. - Т. 64. -N 5. - С. 416-422.
Назаренко М.С. и др., "Сравнительный анализ экспрессии генов в клетках сосудов у больных с клинически выраженным атеросклерозом." Биомедицинская химия 64.5 (2018): 416-422.
Назаренко, М. С., Марков, А. В., Слепцов, А. А., Королёва, Ю. А., Шарыш, Д. В., Зарубин, А. А., Валиахметов, Н. Р., Гончарова, И. А., Муслимова, Э. Ф., Кузнецов, М. С., Козлов, Б. Н., Афанасьев, С. А., Пузырев, В. П. (2018). Сравнительный анализ экспрессии генов в клетках сосудов у больных с клинически выраженным атеросклерозом. Биомедицинская химия, 64(5), 416-422.
Переводная версия в журнале «Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:10.1134/S1990750819010104
Список литературы
Nai W., Threapleton D., Lu J., Zhang K., Wu H., Fu Y., Wang Y., Ou Z., Shan L., Ding Y., Yu Y., Dai M. (2016) Sci. Rep., 6, 18764. CrossRef Scholar google search
Sulkava M., Raitoharju E., Levula M., Seppälä I., Lyytikäinen L.P., Mennander A., Järvinen O., Zeitlin R., Salenius J.P., Illig T., Klopp N., Mononen N., Laaksonen R., Kähönen M., Oksala N., Lehtimäki T. (2017) Sci. Rep., 7, 41483. CrossRef Scholar google search
Steenman M., Espitia O., Maurel B., Guyomarch B., Heymann M.F., Pistorius M.A., Ory B., Heymann D., Houlgatte R., Gouëffic Y., Quillard T. (2018) Sci. Rep., 8, 3940. CrossRef Scholar google search
Stary H.C., Chandler A.B., Dinsmore R.E., Fuster V., Glagov S., Insull W. Jr., Rosenfeld M.E., Schwartz C.J., Wagner W.D., Wissler R.W. (1995) Circulation, 92,(5), 1355-1374. CrossRef Scholar google search
Raitoharju E., Seppälä I., Lyytikäinen L.P., Levula M., Oksala N., Klopp N., Illig T., Laaksonen R., Kähönen M., Lehtimäki T. (2013) Atherosclerosis., 226(1), 149-152. CrossRef Scholar google search
Zenz R., Eferl R., Scheinecker C., Redlich K., Smolen J., Schonthaler H.B., Kenner L., Tschachler E., Wagner E.F. (2008) Arthritis Res. Ther., 10(1), 201. CrossRef Scholar google search
Seo D., Wang T., Dressman H., Herderick E.E., Iversen E.S., Dong C., Vata K., Milano C.A., Rigat F., Pittman J., Nevins J.R., West M., Goldschmidt-Clermont P.J. (2004) Arterioscler. Thromb. Vasc. Biol., 24(10), 1922-1927. CrossRef Scholar google search
Antonopoulos A.S., Margaritis M., Shirodaria C., Antoniades C. (2012) Thromb. Haemost., 108, 840-848. CrossRef Scholar google search
Dichtl W., Dulak J., Frick M., Alber H.F., Schwarzacher S.P., Ares M.P., Nilsson J., Pachinger O., Weidinger F. (2003) Arterioscler. Thromb. Vasc. Biol., 23(1), 58-63. CrossRef Scholar google search
Blaschke S., Viereck V., Schwarz G., Klinger H.M., Guerluek S., Muller G.A. (2009) Scand. J. Rheumatol., 38(4), 235-239. CrossRef Scholar google search
Mocchegiani E., Giacconi R., Cipriano C., Muzzioli M., Gasparini N., Moresi R., Stecconi R., Suzuki H., Cavalieri E., Mariani E. (2002) Exp. Gerontol., 37(2-3), 349-357. CrossRef Scholar google search
Brazão-Silva M.T., Rodrigues M.F., Eisenberg A.L., Dias F.L., de Castro L.M., Nunes F.D., Faria P.R., Cardoso S.V., Loyola A.M., de Sousa S.C. (2015) Histopathology, 67(3), 358-367. CrossRef Scholar google search
