1. Военный институт Министерства обороны,Тирасполь, Молдова 2. Институт физиологически активных веществ Российской академии наук, Черноголовка, Россия 3. Институт молекулярной и трансляционной медицины, факультет медицины и стоматологии, Университет Палацкого в г. Оломоуц, Оломоуц, Чешская Республика
Зависимость между структурой органических соединений и острой токсичностью при пероральном введении мышам изучали с использованием 2D симплексного представления молекулярной структуры и метода “случайного леса” (Random Forest, RF). Были построены удовлетворительные (R2 test = 0,61–0,62) модели количественной связи “структура-активность” (Quantitative Structure-Activity Relationship, QSAR). Проведена интерпретация полученных QSAR моделей. Рассчитаны вклады известных токсикофоров с установленными механизмами действия с целью оценить возможности их ранжирования относительно других структурных фрагментов. Для выявления новых потенциальных токсикофоров проанализировано влияние молекулярного окружения некоторых токсикофоров и вклады других, имеющих высокие ранги, фрагментов из списка общих функциональных групп и циклических систем. При проведении сравнительного QSAR анализа использованы онлайн версия экспертной системы “OCHEM” (https://ochem.eu) и алгоритм AMT (Arithmetic Mean Toxicity).
Тиньков О.В. и др. QSAR-анализ острой токсичности органических соединений при пероральном введении мышам // Биомедицинская химия. - 2019. - Т. 65. -N 2. - С. 123-132.
Тиньков О.В. и др., "QSAR-анализ острой токсичности органических соединений при пероральном введении мышам." Биомедицинская химия 65.2 (2019): 123-132.
Тиньков, О. В., Григорьев, В. Ю., Полищук, П. Г., Ярков, А. В., Раевский, О. А. (2019). QSAR-анализ острой токсичности органических соединений при пероральном введении мышам. Биомедицинская химия, 65(2), 123-132.
Список литературы
Ekins S. (2018) Computational Toxicology: Risk Assessment for Pharmaceutical and Environmental Chemicals, John Wiley & Sons, Hoboken, NJ. CrossRef Scholar google search
Xiao L., Lei C., Feixiong C., Zengrui W., Hanping B., Congying X., Weihua L., Guixia L., Xu S., Yun T. (2014) J. Chem. Inf. Model., 54, 1061-1069. CrossRef Scholar google search
Lagunin A., Zakharov A., Filimonov D., Poroikov V. (2011) J. Molecular Informatics, 30(2-3), 241-250. CrossRef Scholar google search
Lagunin A., Rudik A., Druzhilovsky D., Filimonov D., Poroikov V., Wren J. (2018), Bioinformatics, 34(4), 710-712. CrossRef Scholar google search
Беженцев В.М., Дружиловский Д.С., Иванов С.М., Филимонов Д.А., Sastry N.G., Поройков В.В. (2017) Хим.-фарм. журнал, 51(2), 3-11. Scholar google search
Gonella D.R., Manganelli S., Esposito A., Roncaglioni A., Manganaro A. Benfenati E. (2015) SAR QSAR Environ. Res., 26(1), 1-27. CrossRef Scholar google search
Sosnin S., Karlov D., Tetko I.V., Fedorov M.V. (2018) J. Chem. Inf. Model. (Published: December 27, 2018 online). CrossRef Scholar google search
Раевский О.А. (2013) Свойства химических соединений и лекарств как функции их структуры. КДУ, Добросвет, М. Scholar google search
Раевский О.А., Герасименко В.А., Трепалин С.В. (1999) Свидетельство об официальной регистрации программы для ЭВМ MOLDIVS (Molecular Diversity & Similarity) № 990093 от 26 февраля 1999 г., Москва, Федеральная служба по интеллектуальной собственности, патентами товарным знакам. Scholar google search
Pedregosa F., Varoquaux G., Gramfort A., Michel V., Thirion B., Grisel O., Blondel M., Prettenhofer P., Weiss R., Dubourg V. et al. (2011) J.Mach. Learn. Res., 12, 2825-2830. Scholar google search
Raevsky O., Grigor'ev V., Kireev D., Zefirov N.S. (1992) Quant. Struct.-Act. Relat., 11, 49-63. CrossRef Scholar google search
Sushko Y., Novotarskyi S., Körner R., Vogt J., Abdelaziz A., Tetko I.V. (2014) J. Cheminform., 6(1), 48. CrossRef Scholar google search
Polishchuk P., Tinkov O., Khristova T., Ognichenko L., Kosinskaya A., Varnek A., Kuz’min V. (2016), J. Chem. Inf. Model., 56(8), 1455-1469. CrossRef Scholar google search
Colovic M., Krstic D., Lazarevic-Pasti T., Bondžić A.M., Vasić V.M. (2013) Curr. Neuropharmacol., 11(3), 315-335. CrossRef Scholar google search
Littin K., O’Connor C., Eason C. (2000) New Zealand Plant Protection, 53, 310-315. Scholar google search
Lester P., Myers D. (2012) in: The Laboratory Rabbit, Guinea Pig, Hamster, and Other Rodents (Suckow M., Stevens K., Wilson R., eds.), Academic Press, pp. 33-56. CrossRef Scholar google search
Alves V., Muratov E., Capuzzi S., Politi R., Low Y., Braga R., Zakharov A.V., Sedykh A., Mokshyna E., Farag S. et al. (2016) Green Chem., 18, 4348-4360. CrossRef Scholar google search
