Получена общая модель предсказания величины IC₅₀ (концентрации, вызывающей 50% торможение активности фермента), объединяющая данные для 40 вариантов нейраминидаз вирусов гриппа А (7 серотипов) и B и трёх известных ингибиторов – осельтамивира, занамивира, перамивира – и использующая данные только об энтальпийных вкладах в потенциальную энергию комплексов ингибитор/белок и субстрат/белок (MUNANA). Расчёты адаптированы для использования программного обеспечения с поддержкой графических ускорителей, сокращающего время вычислений. Значения R² для предсказания величин pIC₅₀ для тестовых выборок лежат в пределах 0,45-0,58, значение средней ошибки – 0,7 (при диапазоне обучающей выборки pIC₅₀ от 4,55 до 10,22).
Микурова А.В., Скворцов В.С. (2019) Модель предсказания ингибирования нейраминидаз вируса гриппа А и B на базе ограниченного набора энергетических вкладов. Биомедицинская химия, 65(6), 520-525.
Микурова А.В. и др. Модель предсказания ингибирования нейраминидаз вируса гриппа А и B на базе ограниченного набора энергетических вкладов // Биомедицинская химия. - 2019. - Т. 65. -N 6. - С. 520-525.
Микурова А.В. и др., "Модель предсказания ингибирования нейраминидаз вируса гриппа А и B на базе ограниченного набора энергетических вкладов." Биомедицинская химия 65.6 (2019): 520-525.
Микурова, А. В., Скворцов, В. С. (2019). Модель предсказания ингибирования нейраминидаз вируса гриппа А и B на базе ограниченного набора энергетических вкладов. Биомедицинская химия, 65(6), 520-525.
Переводная версия в журнале «Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:10.1134/S1990750820020092
Список литературы
Бреслав H.В., Шевченко Е.С., Абрамов Д.Д., Прилипов А.Г., Журавлева М.М., Оскерко Т.А., Колобухина Л.В., Меркулова Л.Н., Щелканов М.Ю., Бурцева Е.И., Львов Д.К. (2013) Вопросы вирусологии, 58(1), 28-32. Scholar google search
Air G.M., Laver W.G. (1989) Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics, 6(4), 341-356. CrossRef Scholar google search
Kollman P.A., Massova I., Reyes C., Kuhn B., Huo S., Chong L., Lee M., Lee T., Duan Y., Wang W., Donini O., Cieplak P., Srinivasan J., Case D.A., Cheatham T.E. 3rd (2000) Acc. Chem. Res., 33, 889-897. CrossRef Scholar google search
Federal Research Center Computer Science and Control of Russian Academy of Sciences. Electronic resource:site. – Moscow: FRC CSС RAS. – URL: http://hhpcc.frccsc.ru (application date: 09/11/2019). Scholar google search
