Метаболомика — одна из омиксных наук, технологии которой широко используются сегодня во многих науках о жизни. Её применение дало импульс для открытия новых биомаркеров заболеваний, описания биохимических процессов, протекающих во многих организмах, заложило основы для клинической лабораторной диагностики нового поколения. Целью данного обзора было показать, насколько метаболомика представлена в исследованиях российских ученых, какие основные направления исследований были ими выбраны, продемонстрировать успехи и заслуги отечественной науки в данной области. В обзоре также рассмотрена история возникновения метаболомики, основные её направления, существующие проблемы и место российской метаболомики в их решении.
Загрузить PDF:
Ключевые слова: метаболомика, масс-спектрометрия, российская наука, Институт биомедицинской химии, диагностика заболеваний
Цитирование:
Лохов П.Г., Балашова Е.Е., Трифонова О.П., Маслов Д.Л., Арчаков А.И. (2020) Десять лет российской метаболомике: история развития и основные результаты. Биомедицинская химия, 66(4), 279-293.
Лохов П.Г. и др. Десять лет российской метаболомике: история развития и основные результаты // Биомедицинская химия. - 2020. - Т. 66. -N 4. - С. 279-293.
Лохов П.Г. и др., "Десять лет российской метаболомике: история развития и основные результаты." Биомедицинская химия 66.4 (2020): 279-293.
Лохов, П. Г., Балашова, Е. Е., Трифонова, О. П., Маслов, Д. Л., Арчаков, А. И. (2020). Десять лет российской метаболомике: история развития и основные результаты. Биомедицинская химия, 66(4), 279-293.
Переводная версия в журнале «Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:10.1134/S1990750821010042
Список литературы
Gieger C., Geistlinger L., Altmaier E., de Angelis M.H., Kronenberg F., Meitinger T., Mewes H.W., Wichmann H.E., Weinberger K.M., Adamski J., Illig T., Suhre K. (2008) PLoS Genet., 4, DOI: 10.1371/journal.pgen.1000282. CrossRef Scholar google search
Smith C.A., O'Maille G., Want E.J., Qin C., Trauger S.A., Brandon T.R., Custodio D.E., Abagyan R., Siuzdak G. (2005) Therapeutic Drug Monitoring, 27, 747-751. CrossRef Scholar google search
Beger R.D., Dunn W.B., Bandukwala A., Bethan B., Broadhurst D., Clish C.B., Dasari S., Derr L., Evans A., Fischer S., Flynn T., Hartung T., Herrington D., Higashi R., Hsu P.C., Jones C., Kachman M., Karuso H., Kruppa G., Lippa K., Maruvada P., Mosley J., Ntai I., O'Donovan C., Playdon M., Raftery D., Shaughnessy D., Souza A., Spaeder T., Spalholz B., Tayyari F., Ubhi B., Verma M., Walk T., Wilson I., Witkin K., Bearden D.W., Zanetti K.A. (2019) Metabolomics, 15, DOI: 10.1007/s11306-018-1460-7. CrossRef Scholar google search
Beale D.J., Pinu F.R., Kouremenos K.A., Poojary M.M., Narayana V.K., Boughton B.A., Kanojia K., Dayalan S., Jones O.A.H., Dias D.A. (2018) Metabolomics, 14, DOI: 10.1007/s11306-018-1449-2. CrossRef Scholar google search
Savolainen O., Fagerberg B., Lind M.V., Sandberg A.S., Ross A.B., Bergström G. (2017) PLoS One, 12, DOI: 10.1371/journal.pone.0177738. CrossRef Scholar google search
Liu J., Semiz S., van der Lee S.J., van der Spek A., Verhoeven A., van Klinken J.B., Sijbrands E., Harms A.C., Hankemeier T., van Dijk K.W., van Duijn C.M., Demirkan A. (2017) Metabolomics, 13, DOI: 10.1007/s11306-017-1239-2. CrossRef Scholar google search
van den Berg R.A., Hoefsloot H.C.J., Westerhuis J.A., Smilde A.K., van der Werf M.J. (2006) BMC Genomics, 7, DOI: 10.1186/1471-2164-7-142. CrossRef Scholar google search
Smilde A.K., Jansen J.J., Hoefsloot H.C.J., Lamers R.J.A.N., van der Greef J., Timmerman M.E. (2005) Bioinformatics, 21, 3043-3048. CrossRef Scholar google search
Vis D.J., Westerhuis J.A., Smilde A.K., van der Greef J. (2007) BMC Bioinformatics, 8, DOI: 10.1186/1471-2105-8-322. CrossRef Scholar google search
Jonsson P., Bruce S.J., Moritz T., Trygg J., Sjöström M., Plumb R., Granger J., Maibaum E., Nicholson J.K., Holmes E., Antti H. (2005) Analyst, 130, 701-707. CrossRef Scholar google search
Westergren A., Karlsson S., Andersson P., Ohlsson O., Hallberg I.R. (2001) J. Clin. Nurs., 10, 257-267. CrossRef Scholar google search
Broeckling C.D., Reddy I.R., Duran A.L., Zhao X., Sumner L.W. (2006) Anal. Chem., 78, 4334-4341. CrossRef Scholar google search
Baran R., Kochi H., Saito N., Suematsu M., Soga T., Nishioka T., Robert M., Tomita M. (2006) BMC Bioinformatics, 7, DOI: 10.1186/1471-2105-7-530. CrossRef Scholar google search
Denkert C., Budczies J., Weichert W., Wohlgemuth G., Scholz M., Kind T., Niesporek S., Noske A., Buckendahl A., Dietel M., Fiehn O. (2008) Mol. Cancer, 7, DOI: 10.1186/1476-4598-7-72. CrossRef Scholar google search
Moshkovskii S., Pyatnitsky M., Lokhov P., Baranova A. (2015) in: Biomarkers in Disease: Methods, Discoveries and Applications: Biomarkers in Cancer (Preedy V.R. and Patel V.B., eds.) Springer Nature Switzerland AG, pp. 3-30. CrossRef Scholar google search
Пузанский Р.К., Емельянов В.В., Шаварда А.Л., Гавриленко Т.А, Шишова М.Ф. (2018) Физиология растений, 65(6), 451-462. CrossRef Scholar google search
Shishova M., Puzanskiy R., Gavrilova O., Kurbanniazov S., Demchenko K., Yemelyanov V., Pendinen G., Shavarda A., Gavrilenko T. (2019) Metabolites, 9, DOI: 10.3390/metabo9020024. CrossRef Scholar google search
Лисица А.В., Лохов П.Г., Пономаренко Е.А., Арчаков А.И. (2016) Вестник Российской Академии Медицинских Наук, 71, 255-260. CrossRef Scholar google search
He Y., Yu Z., Giegling I., Xie L., Hartmann A.M., Prehn C., Adamski J., Kahn R., Li Y., Illig T., Wang-Sattler R., Rujescu D. (2012) Transl. Psychiatry, 2, e149. CrossRef Scholar google search
Gorbunova V., Seluanov A., Zhang Z., Gladyshev V.N., Vijg J. (2014) Nat. Rev. Genet., 15, 531-540. CrossRef Scholar google search
