1. Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича, Москва, Россия 2. Институт медико-биологических проблем РАН, Москва, Россия 3. Федеральный исследовательский центр питания и биотехнологии, Москва, Россия
Протеомный состав служит важнейшей характеристикой биологического объекта, позволяющей оценить его состояние. Направленный масс-спектрометрический анализ, а именно мониторинг множественных реакций (multiple reaction monitoring, MRM) с использованием синтетических изотопно-меченых пептидов в качестве внутренних стандартов (SIS) является основной альтернативой методу ИФА для анализа диагностически значимых белков. По результатам работ с применением MRM создан прототип тест-системы, использующей целевой масс-спектрометрический метод для мультиплексного количественного анализа белков, утвержденных Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов (Food and Drug Administration, FDA) в качестве биомаркеров, в цельной плазме крови. С использованием данного подхода удалось измерить содержание 42 белков в 31 образце в диапазоне концентраций, охватывающем 5 порядков величин. При этом, межиндивидуальная вариабельность для 30 из 42 зарегистрированных белков оказалась менее 40%. Наибольший разброс наблюдался при измерении содержания гаптоглобина (68%), константного участка тяжёлой цепи иммуноглобулина класса D (90%), ангиотензина (72%), связывающего половые стероиды глобулина SHBG (100%) и липопротеин-(а) (136%). Полученные результаты по концентрации белков коррелируют с литературными данными (Hortin et al., 2008, Clinical Chemistry, 54, 1608) c R²=0,84. Разработанный прототип тест-системы, основанной на масс-спектрометрическом направленном анализе белков, можно рассматривать в качестве альтернативы методикам, использующим моноклональные антитела.
Загрузить PDF:
Ключевые слова: MRM анализ, изотопно-меченые внутренние пептидные стандарты, FDA-верифицированные белки
Новикова С.Е. и др. Масс-спектрометрический MRM анализ FDA-верифицированных белков в плазме крови здоровых добровольцев // Биомедицинская химия. - 2020. - Т. 66. -N 4. - С. 294-316.
Новикова С.Е. и др., "Масс-спектрометрический MRM анализ FDA-верифицированных белков в плазме крови здоровых добровольцев." Биомедицинская химия 66.4 (2020): 294-316.
Новикова, С. Е., Фарафонова, Т. Е., Тихонова, О. В., Шушкова, Н. А., Пятницкий, М. А., Згода, В. Г., Пономаренко, Е. А., Лисица, А. В., Григорьев, А. И., Тутельян, В. А., Арчаков, А. И. (2020). Масс-спектрометрический MRM анализ FDA-верифицированных белков в плазме крови здоровых добровольцев. Биомедицинская химия, 66(4), 294-316.
Переводная версия в журнале «Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:10.1134/S1990750821010054
Список литературы
Lomnytska M., Pinto R., Becker S., Engström U., Gustafsson S., Björklund C., Templin M., Bergstrand J., Xu L., Widengren J., Epstein E., Franzén B., Auer G. (2018) Biomark. Res, 6(1), 2. CrossRef Scholar google search
Bhardwaj M., Gies A., Werner S., Schrotz-King P., Brenner H. (2017) Clin. Transl. Gastroenterol., 8(11), e128. CrossRef Scholar google search
