Методом тандемной масс-спектрометрии с электроспрейной ионизацией проведен сравнительный анализ белков кератиноцитов линии НаСаТ, кодируемых генами 18 хромосомы, до и после воздействия субтоксических доз додецилсульфата натрия (ДСН; 25 мкг/мл) и тритона X-100 (12,5 мг/мл) в течение 48 ч. Идентификацию белков проводили с использованием платформы SearchGUI (поисковые системы X!Tandem и MS-GF+). Всего в иммортализованных кератиноцитах человека линии НаСаТ обнаружено 1284 белка, из них около 75% идентифицировано по двум и более пептидам. Достоверно идентифицированы 26 белков, кодируемых генами 18 хромосомы; из них 17 являются общими для контрольных клеток и клеток НаСаТ после воздействия ДСН и 15 — общими для контрольных клеток и клеток, обработанных тритоном X-100. Белки MARE2 и CTIF идентифицированы только в контрольных кератиноцитах. Семь идентифицированных белков, кодируемых генами 18 хромосомы, определены только в обработанных ДСН кератиноцитах, LMAN1, NDUV2, SPB3, VPS4B, KDSR, ROCK1, RHG28.
Загрузить PDF:
Ключевые слова: кератиноциты человека линии НаСаТ, додецилсульфат натрия, тритон, SearchGUI, X!Tandem, MS-GF+, хромосома 18, ВЭЖХ-МС/МС
Кисриева Ю.С. и др. Сравнительное исследование протеома клеток HaCaT кератиноцитов человека: идентификация белков, кодируемых генами 18 хромосомы при воздействии детергентов // Биомедицинская химия. - 2020. - Т. 66. -N 6. - С. 469-476.
Кисриева Ю.С. и др., "Сравнительное исследование протеома клеток HaCaT кератиноцитов человека: идентификация белков, кодируемых генами 18 хромосомы при воздействии детергентов." Биомедицинская химия 66.6 (2020): 469-476.
Кисриева, Ю. С., Саменкова, Н. Ф., Ларина, О. В., Згода, В. Г., Карузина, И. И., Русанов, А. Л., Лузгина, Н. Г., Петушкова, Н. А. (2020). Сравнительное исследование протеома клеток HaCaT кератиноцитов человека: идентификация белков, кодируемых генами 18 хромосомы при воздействии детергентов. Биомедицинская химия, 66(6), 469-476.
Русанов А.Л., Лузгина Н.Г., Лисица А.В. (2017) Бюллетень экспериментальной биологии и медицины, 163(2), 256-260. CrossRef Scholar google search
OECD, 2013a. OECD Guideline for the Testing of Chemicals (No. 431): In Vitro Skin Corrosion: Reconstructed Human Epidermis (Rhe) Test Method, OECD, Paris. Scholar google search
OECD, 2013b. OECD Guideline for the Testing of Chemicals (No. 439): In Vitro Skin Irritation — Reconstructed Human Epidermis Test Method, OECD, Paris. Scholar google search
Lindberg M., Forslind B., Sagstrom S., Roomans G.M. (1992) Acta Dermato-Venereologica, 72(6), 428-431. Scholar google search
