1. Институт белка РАН, Пущино, Россия 2. Институт белка РАН, Пущино, Россия; Филиал Института прикладной математики им. М.В. Келдыша РАН, Пущино, Россия 3. Пущинский филиал Института биоорганической химии им. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН, Пущино, Россия 4. Пущинский филиал Института биоорганической химии им. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН, Пущино, Россия; Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии, Оболенск, Россия 5. Институт теоретической и экспериментальной биофизики РАН, Пущино, Россия 6. Институт белка РАН, Пущино, Россия; Институт теоретической и экспериментальной биофизики РАН, Пущино, Россия
Антибиотикорезистентность бактерий является злободневной проблемой мирового масштаба. Подчас активная человеческая деятельность приводит к увеличению представленности в окружающей среде бактерий, устойчивых к действию антибиотиков. Антимикробные пептиды (АМП) являются потенциальными лекарственными кандидатами для борьбы с такими микроорганизмами. Ранее нами был предложен и успешно апробирован на примере Thermus thermophilus новый механизм действия АМП, основанный на направленной коагрегации (взаимодействии пептида, способного формировать фибриллы с белком-мишенью). В настоящей работе рассмотрены критерии выбора мишени для направленного действия АМП, описаны особенности “родительских” S1 рибосомных белков Thermus thermophilus и Escherichia coli и исследуемых пептидов с применением методов биоинформатического анализа, проведена оценка антимикробного действия синтезированных пептидов на модельном организме Escherichia coli и цитотоксичности на клетках фибробластов человека.
Курпе С.Р. и др. Антибактериальные эффекты пептидов, синтезированных на основе последовательности рибосомного белка S1 // Биомедицинская химия. - 2021. - Т. 67. -N 3. - С. 231-243.
Курпе С.Р. и др., "Антибактериальные эффекты пептидов, синтезированных на основе последовательности рибосомного белка S1." Биомедицинская химия 67.3 (2021): 231-243.
Курпе, С. Р., Гришин, С. Ю., Глякина, А. В., Слизень, М. В., Панфилов, А. В., Кочетов, А. П., Сурин, А. К., Кобякова, М. И., Фадеев, Р. С., Галзитская, О. В. (2021). Антибактериальные эффекты пептидов, синтезированных на основе последовательности рибосомного белка S1. Биомедицинская химия, 67(3), 231-243.
Список литературы
McEwen S.A., Collignon P.J. (2018) in: Antimicrobial Resistance in Bacteria from Livestock and Companion Animals: Antimicrobial Resistance: a One Health Perspective (Schwarz S., Cavaco L.M., Shen J., eds.), ASM Press, Washington, pp. 521-547. CrossRef Scholar google search
Fields F.R., Freed S.D., Carothers K.E., Hamid M.N., Hammers D.E., Ross J.N., Kalwajtys V.R., Gonzalez A.J., Hildreth A.D., Friedberg I. et al. (2020) Drug Dev. Res., 81, 43-51. CrossRef Scholar google search
Rajkumari J., Dyavaiah M., Syed A., Siddhardha B. (2020) in: Model Organisms for Microbial Pathogenesis, Biofilm Formation and Antimicrobial Drug Discovery: Model Organisms and Antimicrobial Drug Discovery (Siddhardha B., Dyavaiah M., Syed A., eds.), Springer Singapore, Singapore, pp. 527-543. CrossRef Scholar google search
Pirtskhalava M., Amstrong A.A., Grigolava M., Chubinidze M., Alimbarashvili E., Vishnepolsky B., Gabrielian A., Rosenthal A., Hurt D.E., Tartakovsky M. (2021) Nucleic Acids Res., 49, D288-D297. CrossRef Scholar google search
Grishin S., Deryusheva E., Machulin A., Selivanova O., Glyakina A., Gorbunova E., Mustaeva L., Azev V., Rekstina V., Kalebina T., Surin A., Galzitskaya O. (2020) Int. J. Mol. Sci., 21(15), 5199. CrossRef Scholar google search
Jhong J.H., Chi Y.H., Li W.C., Lin T.H., Huang K.Y., Lee T.Y. (2019) Nucleic Acids Res., 47, D285-D297. CrossRef Scholar google search
Console S., Marty C., García-Echeverría C., Schwendener R., Ballmer-Hofer K. (2003) J. Biol. Chem., 278, 35109-35114. CrossRef Scholar google search
Dathe M., Wieprecht T., Nikolenko H., Handel L., Maloy W.L., MacDonald D.L., Beyermann M., Bienert M. (1997) FEBS Lett., 403, 208-212. CrossRef Scholar google search
Lázár V., Martins A., Spohn R., Daruka L., Grézal G., Fekete G., Számel M., Jangir P.K., Kintses B., Csörgő B. et al. (2018) Nat. Microbiol., 3, 718-731. CrossRef Scholar google search
Liu Y.-Y., Chandler C.E., Leung L.M., McElheny C.L., Mettus R.T., Shanks R.M.Q., Liu J.-H., Goodlett D.R., Ernst R.K., Doi Y. (2017) Antimicrob. Agents Chemother., 61(6), e00580-17. CrossRef Scholar google search
