ПЦР-анализ экспрессии генов хромосомы 18 в ткани печени человека: межиндивидуальная вариабельность

   
Тимошенко О.С.1, Хмелёва С.А.1, Поверенная Е.В.1, Киселёва Я.Ю.2, Курбатов Л.К.1, Радько С.П.1 , Буромский И.В.3, Маркин С.С.1, Лисица А.В.1, Арчаков А.И.1, Пономаренко Е.А.1

1. Институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича, Москва, Россия
2. Российский научный центр рентгенорадиологии, Москва, Россия
3. Российский национальный исследовательский медицинский университет им. Н.И. Пирогова, Москва, Россия
Раздел: Клинико-диагностические исследования
DOI: 10.18097/PBMC20216705418      Идентификатор PubMed: 34730555
Год: 2021  том: 67  выпуск: 5  страницы: 418-426
На примере хромосомы 18 человека проведён ПЦР-анализ межиндивидуальной вариабельности экспрессии 244 генов в ткани печени. В целом количественные профили транскриптома хромосомы 18, выраженные в количестве копий кДНК на единичную клетку, показывают высокую степень корреляции (rp=0,963-0,966). Однако при попарном сравнении доноров экспрессия существенного количества генов (от 13% до 19% в зависимости от способа нормировки экспериментальных данных) различается более чем 4-кратно. При этом доля дифференциально экспрессированных генов возрастает с понижением уровня их экспрессии. Более высокая количественная вариабельность низкопредставленных транскриптов имеет в основном не техническую, а биологическую причину. Биоинформатический анализ межиндивидуальной вариабельности дифференциальной экспрессии генов хромосомы 18 в ткани печени человека не выявил каких-либо статистически значимых групп генов, относящихся к определённым биологическим процессам. Это, по-видимому, указывает на временную природу межиндивидуальной вариабельности их экспрессии, вероятно, отражающую реакцию клеток данного индивидуума на конкретные внешние стимулы.
Загрузить PDF:
Ключевые слова: транскриптом, количественная ПЦР, хромосома 18, ткань печени человека
Дополнительные материалы:
Цитирование:

Тимошенко, О. С., Хмелёва, С. А., Поверенная, Е. В., Киселёва, Я. Ю., Курбатов, Л. К., Радько, С. П., Буромский, И. В., Маркин, С. С., Лисица, А. В., Арчаков, А. И., Пономаренко, Е. А. (2021). ПЦР-анализ экспрессии генов хромосомы 18 в ткани печени человека: межиндивидуальная вариабельность. Биомедицинская химия, 67(5), 418-426.
Переводная версия в журнале
«Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:
10.1134/S1990750822010097
Список литературы  
 2022 (том 68)
 2021 (том 67)
 2020 (том 66)
 2019 (том 65)
 2018 (том 64)
 2017 (том 63)
 2016 (том 62)
 2015 (том 61)
 2014 (том 60)
 2013 (том 59)
 2012 (том 58)
 2011 (том 57)
 2010 (том 56)
 2009 (том 55)
 2008 (том 54)
 2007 (том 53)
 2006 (том 52)
 2005 (том 51)
 2004 (том 50)
 2003 (том 49)