Проанализированы экспериментальные данные (Simats A. et al. (2020) Molecular and Cellular Proteomics, 19(12), 1921-1936), полученные при использовании комплексного мультиомного подхода по выявлению потенциальных биомаркеров крови при ишемическом инсульте у мышей, доступные в базе данных ProteomeXchange (accession code PXD016538). Идентификация пептидов с посттрансляционными модификация (ПТМ) была проведена заново. В качестве ПТМ рассматривали только фосфорилирование и дезаминирование. Различные комбинации данных (ишемическая ткань с неповреждённой, ишемическая ткань с контролем, взятым у мышей после мнимой операции, и т.д.) сравнивали как по отношению представленности (abundance) для модифицированного пептида к немодифицированному варианту, так и по абсолютным значениям представленности. Наиболее вероятное изменение уровня ПТМ показано для 27 белков, к числу которых относятся динамин, гликогенфосфорилаза и белок теплового шока 70 кДа.
Скворцов В.С., Иванова Я.О., Воронина А.И. (2021) Биоинформатическая идентификация белков с меняющимся уровнем посттрансляционных модификаций при экспериментальном ишемическом инсульте у мышей. Биомедицинская химия, 67(6), 475-484.
Скворцов В.С. и др. Биоинформатическая идентификация белков с меняющимся уровнем посттрансляционных модификаций при экспериментальном ишемическом инсульте у мышей // Биомедицинская химия. - 2021. - Т. 67. -N 6. - С. 475-484.
Скворцов В.С. и др., "Биоинформатическая идентификация белков с меняющимся уровнем посттрансляционных модификаций при экспериментальном ишемическом инсульте у мышей." Биомедицинская химия 67.6 (2021): 475-484.
Скворцов, В. С., Иванова, Я. О., Воронина, А. И. (2021). Биоинформатическая идентификация белков с меняющимся уровнем посттрансляционных модификаций при экспериментальном ишемическом инсульте у мышей. Биомедицинская химия, 67(6), 475-484.
Переводная версия в журнале «Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:10.1134/S199075082202007X
Simats A., Ramiro L., García-Berrocoso T., Briansó F., Gonzalo R., Martín L., Sabé A., Gill N., Penalba A., Colomé N., Sánchez A., Canals F., Bustamante A., Rosell A., Montaner J. (2020) Mol. Cell. Proteomics, 19(12), 1921-1936. CrossRef Scholar google search
Ma B., Zhang K., Hendrie C., Liang C., Li M., Doherty-Kirby A., Lajoie G. (2003) Rapid Commun. Mass Spectrom., 17(20), 2337-2342. CrossRef Scholar google search
