Биоинформатическая идентификация белков с меняющимся уровнем посттрансляционных модификаций при экспериментальном ишемическом инсульте у мышей

   
Скворцов В.С.1 , Иванова Я.О.1, Воронина А.И.1

1. Институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича, Москва, Россия
Раздел: Экспериментальные исследования
DOI: 10.18097/PBMC20216706475      Идентификатор PubMed: 34964441
Год: 2021  том: 67  выпуск: 6  страницы: 475-484
Проанализированы экспериментальные данные (Simats A. et al. (2020) Molecular and Cellular Proteomics, 19(12), 1921-1936), полученные при использовании комплексного мультиомного подхода по выявлению потенциальных биомаркеров крови при ишемическом инсульте у мышей, доступные в базе данных ProteomeXchange (accession code PXD016538). Идентификация пептидов с посттрансляционными модификация (ПТМ) была проведена заново. В качестве ПТМ рассматривали только фосфорилирование и дезаминирование. Различные комбинации данных (ишемическая ткань с неповреждённой, ишемическая ткань с контролем, взятым у мышей после мнимой операции, и т.д.) сравнивали как по отношению представленности (abundance) для модифицированного пептида к немодифицированному варианту, так и по абсолютным значениям представленности. Наиболее вероятное изменение уровня ПТМ показано для 27 белков, к числу которых относятся динамин, гликогенфосфорилаза и белок теплового шока 70 кДа.
Загрузить PDF:
Ключевые слова: посттрансляционные модификации, ишемический инсульт, биоинформатика
Дополнительные материалы:
Цитирование:

Скворцов, В. С., Иванова, Я. О., Воронина, А. И. (2021). Биоинформатическая идентификация белков с меняющимся уровнем посттрансляционных модификаций при экспериментальном ишемическом инсульте у мышей. Биомедицинская химия, 67(6), 475-484.
Список литературы  
 2022 (том 68)
 2021 (том 67)
 2020 (том 66)
 2019 (том 65)
 2018 (том 64)
 2017 (том 63)
 2016 (том 62)
 2015 (том 61)
 2014 (том 60)
 2013 (том 59)
 2012 (том 58)
 2011 (том 57)
 2010 (том 56)
 2009 (том 55)
 2008 (том 54)
 2007 (том 53)
 2006 (том 52)
 2005 (том 51)
 2004 (том 50)
 2003 (том 49)