1. Научно-производственный центр “Армбиотехнология” НАН РА, Ереван, Армения 2. Научно-производственный центр “Армбиотехнология” НАН РА, Ереван, Армения; Ереванский Государственный Университет, Ереван, Армения
В настоящее время небелковые аминокислоты и синтетические пептиды широко используются в качестве блоков при создании лекарственных препаратов. Многие протеазы представляют большой интерес для фармакологии в связи с их ключевой ролью в различных патологиях. Бактериальная коллагеназа (КФ 3.4.24.3) является весьма привлекательной мишенью для разработки лекарственных препаратов, поскольку ингибиторы бактериальной коллагенолитической протеазы могут остановить распространение заболеваний, вызванных инфекциями. В данной работе исследовали взаимодействие пептидов, содержащих необычные аминокислоты, с коллагеназой Clostridium histolyticum. По результатам докинг-анализа для дальнейших исследований были отобраны 4 пептида, и был проведён их синтез. Все протестированные соединения ингибировали активность коллагеназы с диапазоном значений IC₅₀ 1,45–2,08 мкМ. Выявлена антибактериальная активность синтезированных соединений в отношении штаммов, устойчивых к антибиотикам. Минимальные ингибирующие концентрации (МИК) были определены в диапазоне 4,6–9,2 мкг/мл.
Саргсян А.С., Карапетян Л.Т., Мхитарян А.В., Степанян Л.А., Саргсян Т.О., Дангян Ю.М., Саргсян А.В., Оганезова Г.Г., Оганесян Н.А. (2024) Моделирование, синтез и in vitro тестирование пептидов на основе небелковых аминокислот в качестве потенциальных антибактериальных соединений. Биомедицинская химия, 70(6), 413-420.
Саргсян А.С. и др. Моделирование, синтез и in vitro тестирование пептидов на основе небелковых аминокислот в качестве потенциальных антибактериальных соединений // Биомедицинская химия. - 2024. - Т. 70. -N 6. - С. 413-420.
Саргсян А.С. и др., "Моделирование, синтез и in vitro тестирование пептидов на основе небелковых аминокислот в качестве потенциальных антибактериальных соединений." Биомедицинская химия 70.6 (2024): 413-420.
Саргсян, А. С., Карапетян, Л. Т., Мхитарян, А. В., Степанян, Л. А., Саргсян, Т. О., Дангян, Ю. М., Саргсян, А. В., Оганезова, Г. Г., Оганесян, Н. А. (2024). Моделирование, синтез и in vitro тестирование пептидов на основе небелковых аминокислот в качестве потенциальных антибактериальных соединений. Биомедицинская химия, 70(6), 413-420.
Список литературы
Giacomini E., Perrone V., Alessandrini D., Paoli D., Nappi C., Degli Esposti L. (2021) Evidence of antibiotic resistance from population-based studies: A narrative review. Infect. Drug Resist., 14, 849–858. CrossRef Scholar google search
Du Y., Li L., Zheng Y., Liu J., Gong J., Qiu Z., Li Y., Qiao J., Huo Y.X. (2022) Incorporation of non-canonical amino acids into antimicrobial peptides: Advances, challenges, and perspectives. Appl. Environ. Microbiol., 88(23), e0161722. CrossRef Scholar google search
Sargsyan A.S., Babayan B.G., Avetisyan N.S., Mkrtchyan A.G., Hovhannisyan A.M., Hovhannisyan N.A. (2018) Heterocyclic substituted non-protein amino acids as inhibitors of Clostridium histolyticum collagenase. Armenian Biological J., 70(1), 12–15. Scholar google search
Karaman R., Jubeh B., Breijyeh Z. (2020) Resistance of gram-positive bacteria to current antibacterial agents and overcoming approaches. Molecules, 25(12), 2888. CrossRef Scholar google search
Hovhannisyan N., Harutyunyan Sh., Hovhannisyan A., Hambardzumyan A., Chitchyan M., Melkumyan M., Oganezova G., Avetisyan N. (2023) The novel inhibitors of serine proteases. Amino Acids, 37(3), 531–536. CrossRef Scholar google search
Trott O., Olson A.J. (2010) AutoDock Vina: Improving the speed and accuracy of docking with a new scoring function, efficient optimization, and multithreading. J. Comput. Chem., 31(2), 455–461. CrossRef Scholar google search
Sargsyan T., Stepanyan L., Israyelyan M., Hakobyan H., Jamgaryan S., Gasparyan A., Saghyan A. (2024) The synthesis and in vitro study of 9-fluorenylmethoxycarbonyl protected non-protein amino acids antimicrobial activity. Eurasian Chem.-Technol. J., 25(4), 235–240. CrossRef Scholar google search
Jolene L.L., Dunn M.K. (2018) Therapeutic peptides: Historical perspectives, current development trends, and future directions. Bioorg. Med. Chem., 26(10), 2700–2707. CrossRef Scholar google search
Bellotto O., Semeraro S., Bandiera A., Tramer F., Pavan N., Marchesan S. (2022) Polymer conjugates of antimicrobial peptides (AMPs) with d-amino acids (d-aa): State of the art and future opportunities. Pharmaceutics, 14(2), 446–465. CrossRef Scholar google search
Wang G., Li X., Wang Z. (2016) APD3: The antimicrobial peptide database as a tool for research and education. Nucleic Acids Res., 44(D1), D1087–D1093. CrossRef Scholar google search
Kerru N., Gummidi L., Maddila S., Gangu K.K., Sreekantha B., Jonnalagadda A. (2020) A review on recent advances in nitrogen-containing molecules and their biological applications. Molecules, 25(8), 1909–1951. CrossRef Scholar google search
Kumar A., Singh A.K., Singh H., Vijayan V., Kumar D., Naik J., Thareja S., Yadav J.P., Pathak P., Grishina M., Verma A., Khalilullah H., Jaremko M., Emwas A.H., Kumar P. (2023) Nitrogen containing heterocycles as anticancer agents: A medicinal chemistry perspective. Pharmaceuticals, 16(2), 299–367. CrossRef Scholar google search
Sargsyan A., Hakobyan H., Mardiyan Z., Jamharyan S., Dadayan A., Sargsyan T., Hovhannisyan N. (2023) Modeling, synthesis and in vitro screening of unusual amino acids and peptides as protease inhibitors. J. Chem. Technol. Metall., 58(3), 615–620. CrossRef Scholar google search
Eckhard U., Schönauer E., Brandstetter H. (2013) Structural basis for activity regulation and substrate preference of clostridial collagenases G, H, and T. J. Biol. Chem., 288(28), 20184–20194. CrossRef Scholar google search
