ВОПРОСЫ МЕДИЦИНСКОЙ ХИМИИ (ISSN 0042-8809)

Моделирование трехмерной структуры цитохрома P450 1A2 и поиск его новых лигандов

   
Белкина Н.В., Скворцов В.С., Иванов А.С., Арчаков А.И.
Идентификатор PubMed: 9916262
Год: 1998  том: 44  выпуск: 5  страницы: 464-473
Вещества, способные ингибировать цитохром Р450 1А2 (CYP1A2), представляют собой перспективный класс новых лекарственных средств, применение которых в клинической практике может стать важным звеном в профилактике онкологических заболеваний. Данная работа посвящена компьютерному моделированию трехмерной структуры CYP1A2 и поиску его новых ингибиторов с помощью скрининга баз данных низкомолекулярных соединений. Моделирование CYP1A2 основывалось на гомологии с бактериальными цитохромами P450 с известной трехмерной структурой. С целью оптимизации структуры активного центра CYP1A2 были созданы модели его комплексов с характерными субстратами (кофеином и 7-этоксирезурфином) с последующей их оптимизацией методами молекулярной динамики в присутствии растворителя. Далее, средствами программ DockSearch и LeapFrog были созданы модели 24 комплексов CYP1A2 с известными лигандами, для которых известны экспериментальные значения константы диссоциации (Kd). На основе этих комплексов была построена 3D-QSAR модель с хорошей предсказательной силой. На заключительном этапе был выполнен поиск лигандов CYP1A2 в базе низкомолекулярных соединений (более 23000 веществ из базы данных фирмы Maybridge и 112 известных лигандов CYP1A2 из базы данных Metabolite фирмы MDL). Было получено 680 потенциальных лигандов CYP1A2 с предсказанной величиной Kd, сравнимой с известными лигандами. В это число вошли 73 соединения из 112 известных лигандов, введенных в качестве внутреннего контроля в тестируемую базу данных.
Загрузить PDF:  
Ключевые слова: цитохром P450 1A2, компьютерное моделирование, трехмерная структура, молекулярный докинг, 3D-QSAR
Цитирование:

Белкина, Н. В., Скворцов, В. С., Иванов, А. С., Арчаков, А. И. (1998). Моделирование трехмерной структуры цитохрома P450 1A2 и поиск его новых лигандов. Вопросы медицинской химии, 44(5), 464-473.
Список литературы  
 2002 (том 48)
 2001 (том 47)