Метаботропные глутаматные рецепторы: молекулярное моделирование трансмембранного домена рецептора MgluR1 и построение модели его димера
Беленикин М.С.1 , Палюлин В.А.1, Зефиров Н.С.2
1. Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, Химический факультет 2. Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, Химический факультет, Институт физиологически активных веществ РАН, Черноголовка
Раздел: Экспериментальные/клинические исследование
Год: 2004
В данной работе проведено построение пространственной структуры трансмембранного домена (ТМД) метаботропного глутаматного рецептора mGluR1, состоящего из семи α-спиралей используя структуру родопсина в качестве белка-шаблона, а также результаты, полученные с помощью метода эволюционного следа (МЭС). Показано, что петельная область между IV и V α-спиралями играет важную роль в связывании лигандов и передаче сигнала. Построена модель димера, в том числе и на основании данных, полученных с помощью МЭС для более чем 700 G-белок сопряженных рецепторов. В ТМД имеются две потенциальные области димеризации (олигомеризации) – между II и III, а также V и VI α-спиралями. Построенная молекулярная модель ТМД, а также экспериментальные данные для N-концевых доменов свидетельствуют об участии в димеризации V и VI α-спиралей, в то время как II и III α-спирали являются дополнительной областью взаимодействия с ТМД других рецепторов при образовании функциональных комплексов
Загрузить PDF:
Цитирование:
Беленикин М.С., Палюлин В.А., Зефиров Н.С. (2004) Метаботропные глутаматные рецепторы: молекулярное моделирование трансмембранного домена рецептора MgluR1 и построение модели его димера. Биомедицинская химия, 50(приложение 1), 16-23.
Беленикин М.С. и др. Метаботропные глутаматные рецепторы: молекулярное моделирование трансмембранного домена рецептора MgluR1 и построение модели его димера // Биомедицинская химия. - 2004. - Т. 50. -N приложение 1. - С. 16-23.
Беленикин М.С. и др., "Метаботропные глутаматные рецепторы: молекулярное моделирование трансмембранного домена рецептора MgluR1 и построение модели его димера." Биомедицинская химия 50.приложение 1 (2004): 16-23.
Беленикин, М. С., Палюлин, В. А., Зефиров, Н. С. (2004). Метаботропные глутаматные рецепторы: молекулярное моделирование трансмембранного домена рецептора MgluR1 и построение модели его димера. Биомедицинская химия, 50(приложение 1), 16-23.
Список литературы
Kunishima N., Shimada Y., Tsuji Y., Sato T., Yamamoto M., Kumasaka T., Nakanishi S., Jingami H., Morikawa K. (2000) Nature, 407(6807), 971–977. Scholar google search
Tsuchiya D., Kunishima N., Kamiya N., Jingami H., Morikawa K. (2002) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 99(5), 2660–2665. Scholar google search
Dean M.K., Higgs C., Smith R.E., Bywater R.P., Snell C.R., Scott P.D., Upton G.J., Howe T.J., Reynolds C.A.(2001) J. Med. Chem., 44(26), 4595–4614. Scholar google search
Bairoch A., Apweiler R. (2000) Nucl. Acids Res., 28(1), 45–48. Scholar google search
Okada T., Fujiyoshi Y., Silow M., Navarro J., Landau E.M., Shichida Y. (2002) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99(9), 5982–5987. Scholar google search
Gouldson P.R., Higgs C., Smith R.E., Dean M.K., Gkoutos G.V., Reynolds C.A. (2000) Neuropsychopharmacology. 23(S4), S60–S77. Scholar google search
Ling K., Wang P., Zhao J., Wu Y.L., Cheng Z.J., Wu G.X., Hu W., Ma L., Pei G. (1999). Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96, 7922–7927. Scholar google search
Ott D., Floersheim P., Inderbitzin W., Stoehr N., Francotte E., Lecis G., Richert P., Rihs G., Flor P.J., Kuhn R., Gasparini F. (2000) J. Med. Chem. 43, 4428–4436. Scholar google search
Ray K., Northup J. (2002) J. Biol. Chem. 277(21), 18908–18913. Scholar google search
Morris G.M., Goodsell D.S., Halliday R.S., Huey R., Hart W.E., Belew R.K., Olson A.J.(1998) J. Comp. Chem. 19, 1639–1662. Scholar google search
Ciruela F., Escriche M., Burgueno J., Angulo E., Casado V., Soloviev M.M., Canela E.I., Mallol J., Chan W.Y., Lluis C., McIlhinney R.A., Franco R. (2001) J. Biol. Chem. 276(21), 18345–18351. Scholar google search
