1. Московский Государственный Университет, Химический факультет, Кафедра физической химии, лаборатория химической кибернетики
Раздел: Экспериментальные/клинические исследование
Год: 2004
Разработан и доведен до программной реализации оригинальный вариант комбинированного метода квантовой и молекулярной механики (КМ/ММ), предназначенный для моделирования химических реакций в белковом окружении, в частности, для описания механизмов ферментативных реакций. Метод основан на теории потенциалов эффективных фрагментов и предполагает разделение ММ-подсистемы на совокупность гибких цепей малых фрагментов, взаимодействующих с квантовой подсистемой и между собой. Созданная компьютерная программа метода КМ/ММ позволяет находить стационарные точки на сложных многомерных потенциальных поверхностях систем, состоящих из нескольких сотен атомов. В приложениях рассмотрены реакции гидролиза пептидных связей, катализируемые сериновыми протеазами, реакции передачи протонов по ориентированным сетям водородных связей в ионных каналах
Немухин А.В. и др. Моделирование механизмов ферментативных реакций комбинированными методами квантовой и молекулярной механики // Биомедицинская химия. - 2004. - Т. 50. -N приложение 1. - С. 49-55.
Немухин А.В. и др., "Моделирование механизмов ферментативных реакций комбинированными методами квантовой и молекулярной механики." Биомедицинская химия 50.приложение 1 (2004): 49-55.
Немухин, А. В., Григоренко, Б. Л., Епифановский, Е. М., Рогов, А. В. (2004). Моделирование механизмов ферментативных реакций комбинированными методами квантовой и молекулярной механики. Биомедицинская химия, 50(приложение 1), 49-55.
