Компьютерный поиск новых ингибиторов интегразы ВИЧ-1

Акимов Д.В.; Филимонов Д.А.; Приказчикова Т.А.; Готтих М.Б.; Поройков В.В.

Компьютерный поиск новых ингибиторов интегразы ВИЧ-1

Акимов Д.В.¹, Филимонов Д.А.¹, Приказчикова Т.А.², Готтих М.Б.², Поройков В.В.¹

1. ГУ НИИ биомедицинской химии им. В. Н. Ореховича РАМН
2. Институт физико-химической биологии им. А. Н. Белозерского МГУ

Раздел: Экспериментальные/клинические исследование

Идентификатор PubMed: 16104397

Год: 2005 том: 51 выпуск: 3 страницы: 335-340

Интеграза – фермент, необходимый для репликации вируса иммунодефицита человека первого типа (ВИЧ-1). В настоящее время ароматические производные дикетокарбоновых кислот рассматриваются в качестве перспективных ингибиторов интегразы ВИЧ-1. Одно из соединений, относящихся к этому классу, находится на стадии клинических испытаний. Мы создали выборку из 90 производных дикетокарбоновых кислот и провели обучение программы PASS. Точность прогноза антиинтегразной активности при скользящем контроле с исключением по одному составила 99% . Среди более чем 700 тысяч структур коммерчески доступных химических соединений проведен поиск новых потенциальных ингибиторов интегразы ВИЧ-1. Отобрано и исследовано 8 веществ, для которых эта активность была предсказана с относительно высокой вероятностью; для двух соединений наличие антиинтегразной активности подтверждено в эксперименте.

Загрузить PDF:

Ключевые слова: интеграза, ВИЧ-1, производные дикетокарбоновых кислот, компьютерное конструирование лекарств

Цитирование:

Акимов, Д. В., Филимонов, Д. А., Приказчикова, Т. А., Готтих, М. Б., Поройков, В. В. (2005). Компьютерный поиск новых ингибиторов интегразы ВИЧ-1. Биомедицинская химия, 51(3), 335-340.

Список литературы

Balzarini J. (1999) Biochem. Pharmacol., 58, 1-27 . Scholar google search
Vella S., Palmisano L. (2000) Antivir. Res., 45, 1-7 . Scholar google search
Patella F.J.J., Delaney K.M., Moorman A.C. (1998) N. Engl. J. Med. 38, 853-860. Scholar google search
Ramratnam B., Mittler J.E., Zhang L., Boden D., Hurley A., Fang E., Macken C.A., Perelson A.S., Markowitz M., Ho D.D. (2000) Nat. Med. , 6, 82-85. Scholar google search
Finzi D., Blankson J., Siliciano J.D., Margolick J.B., Chadwick K., Pierson T., Smith K., Lisziewicz J., Lori E., Flexner C., Quinn T.C., Chaisson R.E., Rosenberg E., Walker В., Gange S., Gallant J., Siliciano R.F. (1999) Nat. Med. , 5, 512-517. Scholar google search
Johnson A.A., Marchand C., Pommier Y. (2004) Curr. Top. Med. Chem., 4, 1059-1077. Scholar google search
Sechi M., Denidas M., Dallocchio R., Dessi A., Bacchi A., Sannia L., Carta E., Palomba M., Ragab O., Chan C., Shoemaker R., Sei S., Dayam R., Neamati N. (2004) J. Med. Chem., 47, 5298-310. Scholar google search
Wai J.S., Egbertson M.S., Payne L.S., Fisher Т.Е., Embrey M.W, Tran L.O., Melamed J.Y., Langford H.M., Guare J.P.Jr., Zhuang L., Grey V.E., Vacca J.P., Holloway M.K., Naylor-Olsen A.M., Hazuda D.J., Felock P.J., Wolfe A.L., Stillmock K.A., Schleif W.A., Gabryelski L.J., Young S.D. (2000) J. Med. Chem., 43, 4923-4926. Scholar google search
Pais G.C., Zhang X., Marchand C., Neamati N., Cowansage K., Svarovskaia E.S., Pathak V.K., Tang Y., Nicklaus M., Pommier Y., Burke T.R.Jr. (2002) J. Med. Chem., 45, 3184-94. Scholar google search
Hazuda D.J., Felock P., Witmer M., Wolfe A., Stillmock K., Grobler J.A, Espeseth A., Gabryelski L, Schleif W., Blau C., Miller M.D. (2000) Science., 287, 646-650. Scholar google search
Grobler J.A., Stillmock К., Hu В., Witmer M., Felock P., Espeseth A.S., Wolfe A., Egbertson M., Bourgeois M., Melamed J., Wai J.S., Young S., Vacca J., Hazuda D.J. (2002) Proc. Natl. Acad. Sci. USA., 99, 6661-6666. Scholar google search
Marchand C., Zhang X., Pais G.C., Cowansage K., Neamati N., Burke T.R.Jr., Pommier Y. (2002) J. Biol. Chera., 277, 12596-12603. Scholar google search
Long Y.Q., JiangX .H., Dayam R., Sanchez Т., Shoemaker R., Sei S., Neamati N. (2004) J. Med. Chem., 47, 2561-2573.