Асм-фишинг белка gp120 на иммобилизованные аптамеры и его масс-спектрометрическая идентификация

   
Бухарина Н.С.1 , Иванов Ю.Д.1, Плешакова Т.О.1, Французов П.А.1, Андреева Е.Ю.1, Кайшева А.Л.1, Изотов А.А.1, Павлова Т.И.1, Зиборов В.С.1, Радько С.П.1, Арчаков А.И.1

1. Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича, Москва, Россия
Раздел:
DOI: 10.18097/PBMC20156103363      Идентификатор PubMed: 26215414
Год: 2015  том: 61  выпуск: 3  страницы: 363-372
Разработан метод фишинга на основе метода атомно-силовой микроскопии (АСМ-фишинг) для детекции белков в растворе аналита с использованием чипа с иммобилизованным аптамером. В основе метода лежит использование эффекта биоспецифического вылавливания целевого белка из большого объёма раствора на небольшую поверхность АСМ-чипа с иммобилизованным аптамером к этому белку, используемого в качестве молекулярного зонда. Такой подход с использованием аптамеров позволяет повысить контрастность АСМ-изображения по сравнению с тем, когда в качестве молекулярных зондов используются антитела. Масс-спектрометрический (МС) анализ позволил достоверно идентифицировать целевой белок на поверхности чипа после биоспецифического фишинга, и, таким образом, доказать образование комплекса. Применение АСМ-чипа с иммобилизованным аптамером также позволяет избежать наложения пиков белка и антитела в масс-спектре.
Загрузить PDF:  
Ключевые слова: gp120 HIV-1, аптамер, атомно-силовая микроскопия, фишинг, масс-спектрометрия
Цитирование:

Бухарина, Н. С., Иванов, Ю. Д., Плешакова, Т. О., Французов, П. А., Андреева, Е. Ю., Кайшева, А. Л., Изотов, А. А., Павлова, Т. И., Зиборов, В. С., Радько, С. П., Арчаков, А. И. (2015). Асм-фишинг белка gp120 на иммобилизованные аптамеры и его масс-спектрометрическая идентификация. Биомедицинская химия, 61(3), 363-372.
Переводная версия в журнале
«Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»:
10.1134/S1990750814020036
Список литературы