Компьютерное конструирование лекарств: от поиска новых фармакологических веществ до системной фармакологии

   
Поройков В.В.1

1. Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича, Москва, Россия
Раздел: Обзоры
DOI: 10.18097/PBMC20206601030      Идентификатор PubMed: 32116224
Год: 2020  том: 66  выпуск: 1  страницы: 30-41
Создание нового лекарственного препарата базируется на анализе известной информации о механизмах возникновения заболевания, молекулярных мишенях и лигандах, взаимодействие которых с определёнными мишенями может оказать терапевтический эффект. Имеющиеся сведения о болезнях, лекарствах, фармакологических эффектах, молекулярных мишенях и лекарственно-подобных веществах с учётом комбинаторики ассоциативных связей между ними соответствуют категории “Больших данных” (Big Data), анализ которых требует применения методов компьютерного конструирования лекарств. Данный обзор обобщает работы коллектива лаборатории структурно-функционального конструирования лекарств Научно-исследовательского института биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича в этой области. Нами разработаны подходы к идентификации перспективных фармакологических мишеней, предсказанию одновременно многих тысяч видов биологической активности по структурной формуле соединения, анализу белок-лигандных взаимодействий на основе оценки локального сходства аминокислотных последовательностей, выявлению вероятных молекулярных механизмов побочного действия лекарственных препаратов, расчёту интегральной токсичности лекарственных соединений с учётом их метаболизма в организме человека, предсказанию устойчивых и чувствительных вариантов штаммов и оценке эффективности комбинаций антиретровирусных препаратов у пациентов с учётом молекулярно-генетических особенностей клинических изолятов ВИЧ-1. Разработанные нами методы реализованы в виде свободно-доступных в сети Интернет веб-сервисов, которые используются тысячами исследователей из многих стран мира с целью отбора наиболее перспективных веществ для синтеза и определения приоритетных направлений экспериментального тестирования их биологической активности.
Загрузить PDF:  
Ключевые слова: химико-биологические взаимодействия, биоинформатика, хемоинформатика, дизайн лекарств на основе структуры лигандов, системная фармакология
Дополнительные материалы:
Цитирование:

Поройков, В. В. (2020). Компьютерное конструирование лекарств: от поиска новых фармакологических веществ до системной фармакологии. Биомедицинская химия, 66(1), 30-41.
Переводная версия в журнале
«Biomedical Chemistry (Moscow) Supplement Series B»: 10.1134/S1990750820030117
Список литературы