Проанализированы доступные в базе данных ProteomeXchange (accession code PXD016538) экспериментальные результаты (Simats et al. (2020) Molecular and Cellular Proteomics, 19(12), 1921-1936), полученные при использовании комплексного мультиомного подхода по выявлению потенциальных биомаркеров ишемического инсульта в крови мышей. В качестве посттрансляционных модификаций рассмотрены ацетилирование, метилирование и убиквитинирование. Анализ достоверности изменения уровня модификации белков оценивали для ишемической ткани в сравнении с неповреждённой инсультом тканью и контролем, взятым у мышей после мнимой операции (sham operation). При уровне статистически значимых различий по критерию Манна-Уитни (p < 0,05) найдено 2 белка (Q02248 и Q8BL66); для еще 7 белков различия находятся на уровне статистической тенденции (p < 0,1). Для 7 из найденных 9 белков в литературе есть данные о связи с ишемией мозга.
Скворцов В.С., Иванова Я.О., Воронина А.И. (2022) Ацетилирование, метилирование и убиквитинирование белков при экспериментальном ишемическом инсульте у мышей: биоинформатический анализ. Биомедицинская химия, 68(5), 390-397.
Скворцов В.С. и др. Ацетилирование, метилирование и убиквитинирование белков при экспериментальном ишемическом инсульте у мышей: биоинформатический анализ // Биомедицинская химия. - 2022. - Т. 68. -N 5. - С. 390-397.
Скворцов В.С. и др., "Ацетилирование, метилирование и убиквитинирование белков при экспериментальном ишемическом инсульте у мышей: биоинформатический анализ." Биомедицинская химия 68.5 (2022): 390-397.
Скворцов, В. С., Иванова, Я. О., Воронина, А. И. (2022). Ацетилирование, метилирование и убиквитинирование белков при экспериментальном ишемическом инсульте у мышей: биоинформатический анализ. Биомедицинская химия, 68(5), 390-397.
Список литературы
Скворцов, В.С., Иванова, Я.О., Воронина, А.И. (2021) Биоинформатическая идентификация белков с меняющимся уровнем посттрансляционных модификаций при экспериментальном ишемическом инсульте у мышей. Биомедицинская химия, 67(6), 475-484. CrossRef Scholar google search
Кисриева Ю.С., Петушкова Н.А., Саменкова Н.Ф., Кузнецова Г.П., Ларина О.В., Теряева Н.Б., Усачев Д.Ю., Згода В.Г., Карузина И.И. (2019) Сравнительный анализ модификаций протеома плазмы крови больных церебральной ишемией на основе метода ВЭЖХ-МС/МС. Биомедицинская химия, 65(3), 251-258. CrossRef Scholar google search
Simats A., Ramiro L., García-Berrocoso T., Briansó F., Gonzalo R., Martín L., Sabé A., Gill N., Penalba A., Colomé N., Sánchez A., Canals F., Bustamante A., Rosell A., Montaner J. (2020) A Mouse Brain-based Multi-omics Integrative Approach Reveals Potential Blood Biomarkers for Ischemic Stroke. Molecular and Cellular Proteomics, 19(12), 1921-1936.
